胚胎干细胞因子DPPA2/4扩增非小细胞肺癌中活跃的H3K4me3-H2AK119ub染色质结构域

资源简介

胚胎干细胞因子DPPA2/4扩增非小细胞肺癌中活跃的H3K4me3-H2AK119ub染色质结构域

GSE310173 是一个来自 NCBI GEO 的肿瘤相关数据集，标题为“Embryonic stem cell factors DPPA2/4 amplify active H3K4me3-H2AK119ub chromatin domains in non-small cell lung cancer”，中文可译为“胚胎干细胞因子 DPPA2/4 扩增非小细胞肺癌中活跃的 H3K4me3-H2AK119ub 染色质结构域”。该数据集归属于肿瘤 / 肺癌分类，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，由 Janith Seneviratne 提交，发布时间为 Nov 17 202。数据集共包含 1 个文件，文件样例为 GSE310173_series_matrix.txt.gz。主题标签涉及高通量测序表达谱分析、GPL18573 平台以及物种编号 9606，整体聚焦于非小细胞肺癌中胚胎干细胞因子与特定染色质结构域之间的关联研究。

【数据集背景】

该数据集围绕非小细胞肺癌展开，研究主题涉及胚胎干细胞因子 DPPA2/4 对活跃的 H3K4me3-H2AK119ub 染色质结构域的扩增作用。从标题可以看出，研究关注的是 DPPA2/4 这两个胚胎干细胞因子在非小细胞肺癌背景下与特定组蛋白修饰染色质区域之间的关系。源站描述指出，该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成，说明其结构上可能整合了多个子系列的数据，用于支撑同一研究主题下的不同实验或分析层面。本站将其归类为肿瘤 / 肺癌，主题标签中包含 Expression profiling by high throughput sequencing，表明数据与高通量测序表达谱相关。

【数据内容】

数据集包含 1 个文件，文件样例为 GSE310173_series_matrix.txt.gz。该文件以 GZIP 压缩包形式提供，属于系列矩阵文件，通常用于汇总表达谱或相关定量信息。主题标签中列出了 GPL18573 平台和 9606 物种编号，分别对应特定的测序平台与人类物种。源站描述仅说明该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成，未提供更详细的样本数量、分组信息、具体基因或染色质区域列表。文件数量为 1，说明当前可获取的数据文件较为集中，适合以单文件方式下载和读取。

【采集与来源】

数据来源于 NCBI GEO，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。作者为 Janith Seneviratne，发布时间为 Nov 17 202。标题和源站描述均指向非小细胞肺癌与胚胎干细胞因子 DPPA2/4 相关的研究。主题标签中的 GPL18573 和 9606 提供了平台与物种层面的来源信息。关于具体样本采集地点、伦理审批、实验条件、测序深度等细节，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于肿瘤 / 肺癌方向的研究，尤其是关注非小细胞肺癌中染色质结构域、组蛋白修饰以及胚胎干细胞因子调控机制的分析。由于主题标签包含 Expression profiling by high throughput sequencing，可用于高通量测序表达谱相关的探索性分析。研究者可将其用于比较或整合分析，以考察 DPPA2/4 与 H3K4me3-H2AK119ub 活跃染色质结构域之间的潜在关联。也可作为非小细胞肺癌表观遗传与转录调控研究的参考数据资源。

【使用方法】

建议下载数据文件 GSE310173_series_matrix.txt.gz，按 GZIP 压缩包格式进行读取。由于文件为系列矩阵形式，通常可使用常规统计或生物信息学工具解压并解析。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入。若后续分析涉及表达谱或染色质相关定量信息，应结合平台注释和物种信息进行解读。对于 SuperSeries 与 SubSeries 之间的关系，可根据源站描述进一步查阅下方列出的子系列。

【质量与限制】

当前可确认的信息包括文件数量为 1、文件样例为 GSE310173_series_matrix.txt.gz、来源为 NCBI GEO、发布时间为 Nov 17 202。源站描述仅说明该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成，未提供样本量、重复数、测序深度、质控指标或统计方法等细节。因此，在缺乏完整元数据的情况下，使用时应谨慎评估数据适用范围。关于数据质量、批次效应、归一化方式以及潜在偏差，源站未提供。

【引用与许可】

作者为 Janith Seneviratne，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，发布时间为 Nov 17 202。引用时应注明数据集标题、来源站及作者信息。关于许可条款、使用限制或授权方式，源站未提供。