肺癌免疫治疗相关代谢亚型数据集
研究基于代谢通路聚类，整合临床病理、基因组变量及生存信息与转录组分析，识别可能用于判断免疫肿瘤药物疗效的代谢特征。源站首次发布：Sep 30 202
基本信息
资源简介
肺癌免疫治疗相关代谢亚型数据集
Clinically relevant metabolic subtypes of lung cancer for immunotherapy
该数据集来自 NCBI GEO，标题为 Clinically relevant metabolic subtypes of lung cancer for immunotherapy，聚焦非小细胞肺癌（NSCLC）中与免疫治疗疗效相关的代谢通路亚型。研究基于代谢通路聚类，整合临床病理、基因组变量及生存信息与转录组分析，识别可能用于判断免疫肿瘤药物疗效的代谢特征。数据包含 1 个文件，样例为 GSE309652_series_matrix.txt.gz，采用表达谱芯片平台 GPL31904，物种为人类（9606），可用于探索代谢特征与 anti-PD-(L)1 治疗反应的关系（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Sep 30 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：代谢通路亚型（MPSs）在 anti-PD-(L)1 治疗结局上表现出明显差异。利用基于代谢通路的聚类，我们识别出可能用于判断免疫肿瘤药物在非小细胞肺癌（NSCLC）中疗效的临床相关代谢特征。这些发现提示代谢特征在塑造免疫肿瘤治疗反应中起关键作用。为建立这些关系，我们将个体临床数据，包括临床病理和基因组变量以及生存信息，整合进转录分析中。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：Expression profiling by array、GPL31904、9606。本站分类：肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE309652
【使用注意】
· 源站最后修改于 Oct 01 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE309652
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
代谢通路亚型（MPSs）在抗PD-(L)1治疗结果上显示出显著差异。通过基于代谢通路的聚类分析，我们识别出与临床相关的代谢特征，这些特征可能用于判断免疫肿瘤药物在非小细胞肺癌（NSCLC）中的疗效。这些发现提示，代谢特征在塑造免疫肿瘤治疗反应中起着关键作用。为了确立这些关系，我们将个体临床数据，包括临床病理学和基因组变量，以及生存信息，整合到转录分析中。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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