肺癌细胞中ALKBH5互作RNA的RIP-Seq鉴定
该数据集来自 NCBI GEO,通过 RNA 免疫沉淀测序(RIP-Seq)鉴定肺癌细胞中与 m6A 去甲基化酶 ALKBH5 结合的 RNA,尤其是 lncRNA

基本信息
资源简介
肺癌细胞中ALKBH5互作RNA的RIP-Seq鉴定
Identification of ALKBH5-interacting RNAs in lung cancer cells by RNA immunoprecipitation sequencing (RIP-Seq)
该数据集来自 NCBI GEO,通过 RNA 免疫沉淀测序(RIP-Seq)鉴定肺癌细胞中与 m6A 去甲基化酶 ALKBH5 结合的 RNA,尤其是 lncRNA。实验使用 95D 细胞,在葡萄糖或谷氨酰胺缺乏条件下培养,以 ALKBH5 抗体进行免疫沉淀,分离共沉淀 RNA 并构建测序文库,分析富集的转录本。数据包含 1 个文件,可用于研究营养应激下 ALKBH5 的 RNA 结合特征及其在肺癌中的调控作用(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Sep 29 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):本实验旨在鉴定在营养应激条件下与 m6A 去甲基化酶 ALKBH5 结合的 RNA,尤其是 lncRNA。将葡萄糖或谷氨酰胺缺乏条件下培养的 95D 细胞裂解液,使用抗 ALKBH5 抗体进行免疫沉淀。分离共沉淀的 RNA,用于构建测序文库,并分析以鉴定富集的转录本。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Other、GPL24676、9606。本站分类:肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE309436
【使用注意】
· 源站最后修改于 Oct 27 202,引用时请注意版本时效。
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数据说明
This experiment was performed to identify the RNAs, particularly lncRNAs, that bind to the m6A demethylase ALKBH5 under nutrient stress. Lysates from 95D cells cultured under glucose- or glutamine-deficient conditions were subjected to immunoprecipitation using an antibody against ALKBH5. Co-precipitated RNAs were isolated, used to construct sequencing libraries, and analyzed to identify enriched transcripts.
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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