HDAC抑制解锁Myc驱动小细胞肺癌的肿瘤可塑性与免疫治疗响应 [ATAC-Seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE309213

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

小细胞肺癌（SCLC）是一种高度侵袭性的恶性肿瘤，约占所有肺癌病例的15%。SCLC以低免疫原性为特征，可能利用表观遗传机制逃避免疫检测。在此，我们证明恩替诺特，一种I类组蛋白去乙酰化酶抑制剂（HDACi），可上调人SCLC细胞中的免疫相关基因。在体内，我们在Rb1/Trp53/MycT58A（RPM）SCLC小鼠模型中证实，恩替诺特治疗增加了Myc驱动肿瘤中免疫检查点配体和抗原呈递机制的表达，同时使肿瘤从神经内分泌（NE）高表型向NE低表型转变。值得注意的是，在RPM同种移植模型中，将恩替诺特与抗PD-1免疫治疗联合可显著增强T细胞浸润、抑制肿瘤生长并延长生存期。这些发现强调了恩替诺特在重编程SCLC免疫学格局和NE状态、增强免疫检查点阻断疗效以及改善治疗结局方面的潜力。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。