肺腺癌细胞在3D与2D环境下对机械应激的差异响应
该数据集来自NCBI GEO,包含肺腺癌细胞在三维与二维培养环境下对机械应激响应的表达谱数据,采用高通量测序,样本平台为GPL20795,物种为人(9606)

基本信息
资源简介
肺腺癌细胞在3D与2D环境下对机械应激的差异响应
Lung adenocarcinoma cells respond differently to mechanical stress in 3D versus 2D environments
该数据集来自NCBI GEO,包含肺腺癌细胞在三维与二维培养环境下对机械应激响应的表达谱数据,采用高通量测序,样本平台为GPL20795,物种为人(9606)。研究通过将人肺腺癌细胞接种到去细胞大鼠肺中,并在模拟呼吸运动和血流的压力腔与灌注系统中培养,比较3D与2D培养下的基因表达差异。数据可用于分析细胞黏附、增殖、凋亡及力学信号通路相关基因变化,支持肺癌微环境与机械生物学研究(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Sep 24 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):二维(2D)培养模型常用于癌症研究,但无法重现天然组织的复杂机械线索。在本研究中,我们通过将人肺腺癌细胞接种到去细胞大鼠肺中,并在模拟呼吸运动(RM)和血流的压力腔与灌注系统中培养,建立了一种离体三维(3D)肺癌模型。在3D培养中,RM促进细胞黏附和增殖,增强β-catenin和YAP的核转位,并增加整合素β1和E-cadherin的表达。此外,细胞外基质和细胞黏附相关基因的上调尤为显著。相反,在2D培养中,RM抑制细胞增殖并诱导凋亡,同时肿瘤抑制基因显著上调。我们的研究结果表明,维度和机械应激
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL20795、9606。本站分类:肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE309016
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jan 15 202,引用时请注意版本时效。
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数据说明
Two-dimensional (2D) culture models are commonly used in cancer research, but fail to recapitulate complex mechanical cues of native tissues. In this study, we developed an ex vivo three-dimensional (3D) lung cancer model by seeding human lung adenocarcinoma cells into decellularised rat lungs and culturing them in a pressure chamber and perfusion system mimicking respiratory motion (RM) and blood flow. In 3D culture, RM promoted cell adhesion and proliferation, enhanced the nuclear translocation of β-catenin and YAP, and increased the expression of integrin β1 and E-cadherin. In addition, upregulation of extracellular matrix- and cell adhesion-related genes was particularly notable. In contrast, in 2D culture, RM suppressed cell proliferation and induced apoptosis, with prominent upregulation of tumour suppressor genes. Our findings demonstrate that dimensionality and mechanical stress synergistically influence lung cancer cell dynamics and underscore the need for 3D models in cancer research that closely replicate the native lung tissue microenvironment.
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