多组学揭示尘螨诱导肺癌进展中微环境重塑的关键驱动作用

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE308855

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

长期暴露于常见气传过敏原屋尘螨（HDM）可诱导肺部炎症和DNA损伤，但其对肺癌发生发展的影响在很大程度上仍未被探索。我们利用全基因组测序、RNA测序和DNA甲基化谱分析，评估了HDM对肺上皮细胞系和小鼠原位肺癌模型的影响。HDM加速了肿瘤生长，但未改变突变负荷。转录组和表观遗传分析揭示了组织特异性效应：在正常肺组织中，HDM增强了促炎和免疫激活程序，而在肿瘤中则抑制了T细胞反应、抗原呈递和趋化因子信号传导。免疫解卷积显示向髓系富集和淋系抑制的转变，细胞毒性T细胞和NK细胞特征减少。值得注意的是，HDM驱动的肿瘤促进作用在Il17a−/−小鼠中被消除，但在Il1b−/−小鼠中未被消除，表明IL-17A是关键介质。这些发现表明，长期气传过敏原暴露重塑肺部微环境，促进免疫抑制并加速肺癌进展。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。