超级增强子介导的SMAD3-NR2F2-ID3转录复合物调控非小细胞肺癌Osimertinib耐药 [ChIP-seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE308411

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

奥希替尼耐药仍然是非小细胞肺癌（NSCLC）治疗中的一大挑战。在此，我们鉴定出一个由非常规超级增强子驱动的转录模块，由SMAD3、NR2F2和ID3组成，其中ID3作为转录辅因子维持耐药性。在机制上，ID3直接与SMAD3和NR2F2相互作用，诱导构象重排，增强它们对增强子区域的DNA结合亲和力，从而提高转录活性。该ID3-SMAD3/NR2F2复合物选择性激活EPAS1，进而促进神经内分泌分化并抑制铁死亡，从而维持耐药表型。破坏该复合物可消除EPAS1表达，并在临床前模型中恢复奥希替尼敏感性。我们的发现揭示了ID3作为转录辅因子此前未被认识的作用，并强调超级增强子驱动的SMAD3–NR2F2–ID3–EPAS1轴是克服NSCLC中奥希替尼耐药的有前景的治疗靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。