合成齐墩果烷三萜类化合物抑制肿瘤生长并促进抗肿瘤免疫应答且不依赖癌症KEAP1突变状态

研究关注合成齐墩果烷三萜类化合物对肿瘤生长及抗肿瘤免疫应答的影响,并探讨其作用是否独立于癌症 KEAP1 突变状态。数据可用于分析 KEAP1 野生型与突变型肿瘤在药物处理下的基因表达差异,以及肿瘤免疫微环境中巨噬细胞等细胞群体的转录变化(来源 NCBI)

geo
浏览 11
基因组分类GPL3429010090
GSE308273: Synthetic oleanane triterpenoids reduce tumor growth and promote an anti-tumor immune response independent of cancer KEAP1-mutational status

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-12

资源简介

合成齐墩果烷三萜类化合物抑制肿瘤生长并促进抗肿瘤免疫应答且不依赖癌症KEAP1突变状态

Synthetic oleanane triterpenoids reduce tumor growth and promote an anti-tumor immune response independent of cancer KEAP1-mutational status

该数据集来自 NCBI GEO,包含 1 个文件 GSE308273_series_matrix.txt.gz,属于高通量测序表达谱数据,物种为小鼠(10090),平台为 GPL34290。研究关注合成齐墩果烷三萜类化合物对肿瘤生长及抗肿瘤免疫应答的影响,并探讨其作用是否独立于癌症 KEAP1 突变状态。数据可用于分析 KEAP1 野生型与突变型肿瘤在药物处理下的基因表达差异,以及肿瘤免疫微环境中巨噬细胞等细胞群体的转录变化(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Sep 17 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):KEAP1 负调控细胞保护因子 NRF2,在肺癌细胞中常失活。癌细胞中 KEAP1 功能缺失突变通过免疫抑制和耐药性促进 NRF2 激活和肿瘤免疫逃逸。与直觉相反,使用合成齐墩果烷三萜类化合物(强效 NRF2 激活剂)治疗可减轻临床前肿瘤负荷。这表明这些药物在癌症模型中的功能性靶点不是癌细胞,而是另一个肿瘤免疫微环境(TIME)细胞群体。在 KEAP1 野生型癌症中,三萜类化合物治疗增强了 TIME 内细胞(尤其是巨噬细胞)的抗肿瘤潜力。由于 KEAP1 突变癌症表现出肿瘤免疫应答减弱,三萜类化合物介导的免疫刺激可能特别有益于这些病例,但尚未对此进行研究。为表征 i

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL34290、10090。本站分类:肿瘤/肺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE308273

【使用注意】

· 源站最后修改于 Feb 11 202,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE308273

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

KEAP1 negatively regulates the cytoprotective factor NRF2 and is commonly inactivated in lung cancer cells. Loss of function KEAP1 mutations in cancer cells contribute to NRF2 activation and tumor immune evasion through immunosuppression and drug resistance. Counterintuitively, treatment with synthetic oleanane triterpenoids, potent NRF2 activa-tors, reduces preclinical tumor burden. This suggests the functional target of these drugs in cancer models is not the cancer cells but another tumor immune microenvironment (TIME) cell population. The anti-tumor potential of cells within the TIME, particularly macrophages, is potentiated by triterpenoid treatment in cancers with wild-type KEAP1 status. As KEAP1-mutant cancers show reduced tumor immune responses, triterpenoid-mediated immune stimulation may particularly benefit these cases, but this has not been investigated. To characterize the immunomodulatory effects of triterpenoids in KEAP1-mutant lung cancer, we studied tumor-educated bone marrow-derived macrophages (TE-BMDMs) and lung cancer models treated with the triterpenoids CDDO-Me or omaveloxolone. RNA-sequencing of TE-BMDMs cultured in KEAP1 KO compared to WT cancer-conditioned media had enhanced tumor-promoting phenotypes which reversed with CDDO-Me treatment. Similarly, subcutaneous KEAP1 KO tumors were larger and more immune-suppressed compared to WT tumors. Both CDDO-Me and omaveloxolone reduced tumor burden and improved immune cell phenotypes within the TIME, independent of KEAP1 mutational status.

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案