CASSIA：用于单细胞RNA测序数据无参考、可解释、自动化细胞注释的多智能体大语言模型
数据对应CASSIA——一种用于单细胞RNA测序数据无参考、可解释、自动化细胞注释的多智能体大语言模型，覆盖970种细胞类型的分析场景，可用于细胞类型注释方法的基准评测与复杂及稀有细胞群注释研究（来源 NCBI）
基本信息
资源简介
CASSIA：用于单细胞RNA测序数据无参考、可解释、自动化细胞注释的多智能体大语言模型
CASSIA: a multi-agent large language model for reference free, interpretable, and automated cell annotation of single-cell RNA-sequencing data
该数据集来自NCBI GEO（GSE307976），包含1个文件GSE307976_series_matrix.txt.gz，主题为Expression profiling by high sequencing，物种为人（9606），平台GPL24676，本站归类为肿瘤/肺癌。数据对应CASSIA——一种用于单细胞RNA测序数据无参考、可解释、自动化细胞注释的多智能体大语言模型，覆盖970种细胞类型的分析场景，可用于细胞类型注释方法的基准评测与复杂及稀有细胞群注释研究（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Sep 12 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：细胞类型注释是单细胞RNA测序分析中的关键步骤，现有注释方法众多。多数方法需要计算与领域专业知识的结合，且常产生不一致、难以解释的结果。大语言模型有望扩大可及性、减少人工输入并提高准确性，但现有方法存在过度自信、幻觉和缺乏推理的问题。为解决这些局限，我们开发了CASSIA，用于单细胞RNA测序数据的自动化、准确且可解释的细胞注释。如对970种细胞类型的分析所示，CASSIA在基准数据集以及复杂和稀有细胞群中提高了注释准确性，并为用户提供推理和质量评估，以确保可解释性、防范ha
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL24676、9606。本站分类：肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE307976
【使用注意】
· 源站最后修改于 Feb 18 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE307976
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
细胞类型注释是单细胞RNA测序分析中的关键步骤，目前已有多种注释方法可供使用。大多数方法需要计算与领域专业知识的结合，且常产生不一致的结果，难以解读。大语言模型有望在减少人工输入和提高准确性的同时扩展可及性，但现有方法存在过度自信、幻觉和缺乏推理等问题。为解决这些局限，我们开发了CASSIA，用于对单细胞RNA测序数据进行自动化、准确且可解释的细胞注释。在对970种细胞类型的分析中，CASSIA在基准数据集以及复杂和稀有细胞群体中均提高了注释准确性，并为用户提供推理和质量评估，以确保可解释性、防范幻觉并校准置信度。
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