V gamma 1 gamma-delta T 细胞引导气道巨噬细胞促纤维化反应的自发性肺癌小鼠模型 scRNA-Seq
该数据集来自 NCBI GEO,标题为 V gamma 1 gamma-delta T 细胞引导气道巨噬细胞促纤维化反应的自发性肺癌小鼠模型 scRNA-Seq,包含 1 个文件 GSE307497_series_matrix.txt.gz,采用高通量测序进行表达谱分析,物种为小鼠(10090),平
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基本信息
资源简介
V gamma 1 gamma-delta T 细胞引导气道巨噬细胞促纤维化反应的自发性肺癌小鼠模型 scRNA-Seq
V gamma 1 gamma-delta T cells steer airway macrophages towards a pro-fibrotic response in an autochthonous lung cancer mouse model [scRNA-Seq]
该数据集来自 NCBI GEO,标题为 V gamma 1 gamma-delta T 细胞引导气道巨噬细胞促纤维化反应的自发性肺癌小鼠模型 scRNA-Seq,包含 1 个文件 GSE307497_series_matrix.txt.gz,采用高通量测序进行表达谱分析,物种为小鼠(10090),平台为 GPL24247。数据可用于研究肺癌发生过程中 gamma-delta T 细胞亚群扩增、与巨噬细胞的相互作用以及促纤维化气道巨噬细胞亚群的变化,并支持比较 Tcrd 敲除、V gamma 1 清除抗体处理及 TcrgV4/6 敲除等条件下的免疫细胞组成与表达特征(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Sep 09 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):Gamma-delta T 细胞对呼吸道黏膜的宿主防御很重要,可直接发挥作用或通过与其他细胞相互作用发挥作用。然而,Gamma-Delta T 细胞如何影响肺内其他免疫细胞仍不清楚。使用肺癌基因工程小鼠模型,我们表明肿瘤驱动 CD27+ 和 CD27— Gamma-Delta T 细胞的扩增。先进显微技术表明,CD27— Gamma-Delta T 细胞在肿瘤中富集,而 CD27+ Gamma-Delta T 细胞更倾向于与肿瘤相关外膜套中的巨噬细胞相互作用。SiglecFlow 促纤维化气道巨噬细胞在荷瘤小鼠肺中比无瘤小鼠更普遍。当癌症模型与 Tcrd 敲除小鼠杂交或用 V Gamma1 清除抗体处理时,该促纤维化亚群在肺中减少,但在 TcrgV4/6 敲除小鼠中未减少。因此,我们的发现 im
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24247、10090。本站分类:肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE307497
【使用注意】
· 源站最后修改于 Apr 14 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
γδT细胞对呼吸道黏膜的宿主防御至关重要,它们可以直接发挥作用,也可以通过与其他细胞的相互作用来行使功能。然而,γδT细胞如何影响肺部的其他免疫细胞仍不清楚。利用基因工程小鼠肺癌模型,我们发现肿瘤促进了CD27+和CD27—γδT细胞的扩增。先进的显微镜技术表明,CD27—γδT细胞在肿瘤中富集,而CD27+γδT细胞更倾向于与肿瘤相关外膜套中的巨噬细胞相互作用。SiglecFlow促纤维化气道巨噬细胞在荷瘤小鼠中比无瘤小鼠更为普遍。当癌症模型与Tcrd敲除小鼠杂交或用Vγ1耗竭抗体处理时,肺中这种促纤维化亚群减少,但在TcrgV4/6敲除小鼠中并未减少。因此,我们的研究结果表明Vγ1γδT细胞驱动了肿瘤相关气道巨噬细胞的功能印记。确定其对人类健康的可转化性可能为优化患者管理和免疫治疗策略提供新途径。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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