PRT3789处理NCI-H1693细胞的ATAC-seq分析
该数据集为NCI-H1693非小细胞肺癌细胞经选择性SMARCA2降解剂PRT3789(50 nM)或DMSO对照处理48小时后进行的ATAC-seq分析,包含1个series matrix文件

基本信息
资源简介
PRT3789处理NCI-H1693细胞的ATAC-seq分析
ATAC-seq analysis of NCI-H1693 cells treated with the selective SMARCA2 degrader PRT3789
该数据集为NCI-H1693非小细胞肺癌细胞经选择性SMARCA2降解剂PRT3789(50 nM)或DMSO对照处理48小时后进行的ATAC-seq分析,包含1个series matrix文件。数据覆盖全基因组染色质可及性变化,可用于识别差异可及区域,帮助解释SMARCA4缺陷背景下合成致死的机制,适用于染色质可及性预测与机制研究(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Sep 09 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):本研究的目的是表征在SMARCA4缺陷的非小细胞肺癌模型中,SMARCA2降解诱导的全基因组染色质可及性变化。NCI-H1693细胞用选择性SMARCA2降解剂PRT3789(50 nM)或溶剂对照(DMSO)处理48小时。进行ATAC-seq以识别差异可及性区域,这些区域可能有助于解释SMARCA4缺陷背景下的合成致死机制。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL20795、9606。本站分类:肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE307426
【使用注意】
· 源站最后修改于 Sep 18 202,引用时请注意版本时效。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE307426
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本研究旨在表征SMARCA4缺陷的非小细胞肺癌模型中,由SMARCA2降解诱导的全基因组染色质可及性变化。NCI-H1693细胞经选择性SMARCA2降解剂PRT3789(50 nM)或溶剂对照(DMSO)处理48小时。通过ATAC-seq鉴定差异可及性区域,以助于解释SMARCA4缺陷背景下的合成致死机制。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失?
依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。




