KEAP1失活肺癌中泛素信号脆弱性靶向研究

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE306334

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

肺癌细胞依赖蛋白质稳态调节因子，尤其是泛素-蛋白酶体系统（UPS），以维持其恶性特征。UPS组分（如E3泛素连接酶（E3s）和去泛素化酶（DUBs））的遗传改变十分常见，并形成依赖于背景的治疗脆弱性。为探究这些变化如何驱动肿瘤形成，我们对处于代谢应激状态的小鼠肺癌模型进行了CRISPR筛选，并鉴定出特定的癌症脆弱性靶点，包括KEAP1。尽管KEAP1在侵袭性非小细胞肺癌（NSCLC，约15%）中频繁突变，我们的研究结果揭示了KEAP1在遗传学定义明确的NSCLC亚群中出乎意料的原癌基因作用。在机制上，Keap1缺失激活NRF2并上调Aldh3a1。这导致NADH/NAD⁺比值升高，触发还原性应激，并抑制肿瘤生长。鉴于KEAP1突变患者预后不良，组合CRISPR敲除筛选揭示了可成药的E3s和DUBs作为Keap1依赖的共脆弱性靶点。值得注意的是，耗竭这些共依赖因子（如E3连接酶Herc2、Ubr4和Huwe1）可消除Keap1失活肿瘤的体内发展。

我们证明，针对UPS是一种尚未充分探索、但前景广阔的治疗策略，适用于KEAP1失活肿瘤患者，尤其是在代谢应激条件下。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。