GSE305896:同源肽刺激联合抗增殖药物选择性靶向HIV感染克隆
该数据集来自NCBI GEO,包含一个系列矩阵文件,围绕HIV感染CD4+ T细胞克隆扩增这一清除障碍展开。研究基于精英控制者ES24在转移性肺癌化疗后感染克隆频率下降的现象,检验活跃增殖维持的CD4+ T细胞克隆对化疗药物更易感的假说

基本信息
资源简介
GSE305896:同源肽刺激联合抗增殖药物选择性靶向HIV感染克隆
Selective targeting of HIV infected clones by cognate peptide stimulation and antiproliferative drugs
该数据集来自NCBI GEO,包含一个系列矩阵文件,围绕HIV感染CD4+ T细胞克隆扩增这一清除障碍展开。研究基于精英控制者ES24在转移性肺癌化疗后感染克隆频率下降的现象,检验活跃增殖维持的CD4+ T细胞克隆对化疗药物更易感的假说。数据涉及整合于ZNF721/ABCA11P基因的复制 competent 前病毒克隆ZNF721i,经同源肽刺激后暴露于紫杉醇、卡铂或霉酚酸酯。可用于分析药物对感染克隆的选择性作用(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Aug 19 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):HIV感染CD4+ T细胞的克隆扩增是HIV清除的障碍。我们此前描述,一名精英控制者(ES24)在因转移性肺癌开始接受包含紫杉醇和卡铂方案的放化疗后,克隆扩增最显著的感染CD4+ T细胞频率出现明显下降。我们检验了以下假说:这一现象是由于由活跃增殖维持的CD4+ T细胞克隆对化疗药物具有更高的易感性。我们研究了一个CD4+ T细胞克隆,其具有整合到ZNF721/ABCA11P基因中的复制 competent 前病毒,称为ZNF721i。我们用其同源肽刺激该克隆,然后将细胞暴露于紫杉醇和/或卡铂或抗增殖药物霉酚酸酯。虽然单独用同源肽处理细胞导致明显扩增
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Other、GPL24676、9606。本站分类:肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE305896
【使用注意】
· 源站最后修改于 Nov 24 202,引用时请注意版本时效。
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数据说明
HIV感染CD4+ T细胞的克隆扩增是HIV清除的障碍。我们此前报道,在一名精英控制者(ES24)中,因转移性肺癌接受含紫杉醇和卡铂方案的放化疗后,其体内克隆扩增最显著的感染CD4+ T细胞频率明显下降。我们检验了以下假说:这一现象是由于受活跃增殖维持的CD4+ T细胞克隆对化疗药物具有更高的易感性。我们研究了一个CD4+ T细胞克隆,其携带具有复制能力的原病毒,整合于ZNF721/ABCA11P基因,命名为ZNF721i。我们用其同源肽刺激该克隆,随后将细胞暴露于紫杉醇和/或卡铂或抗增殖药物霉酚酸酯。单独用同源肽处理细胞可导致ZNF721i克隆显著扩增,而用同源肽处理后再用紫杉醇或霉酚酸酯培养则消除了这一过程。这些药物不影响其他非同源肽特异性CD4+ T细胞克隆的增殖。
这种先进行抗原特异性刺激、随后使用抗增殖剂治疗的策略,可能有助于选择性清除克隆扩增的HIV感染细胞。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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