裸鼹鼠肺癌自体模型数据集
研究通过 CRISPR 介导基因组编辑引入致癌 Eml4-Alk 融合蛋白,发现仅该倒位不足以在裸鼹鼠肺中驱动肿瘤发生,还需额外缺失抑癌基因 p53 和 pRb

基本信息
资源简介
裸鼹鼠肺癌自体模型数据集
An autochthonous model of lung cancer in the Naked Mole-Rat (Heterocephalus glaber)
该数据集来自 NCBI GEO(GSE305565),聚焦裸鼹鼠(Naked Mole-Rat)肺癌自体模型。研究通过 CRISPR 介导基因组编辑引入致癌 Eml4-Alk 融合蛋白,发现仅该倒位不足以在裸鼹鼠肺中驱动肿瘤发生,还需额外缺失抑癌基因 p53 和 pRb。数据包含 1 个文件(GSE305565_series_matrix.txt.gz),属于高通量测序表达谱分析,可用于研究物种间癌症发生率差异机制及肿瘤起始过程(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Aug 15 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):越来越多的人对理解物种间癌症发病率差异的机制感兴趣。裸鼹鼠(NMR)常被称为“抗癌”物种,此前研究集中于识别解释这一现象的机制。然而,在体内评估这一点的努力有限。在此,我们提供证据表明,NMR 表现为一种新型的肺肿瘤起始自体模型,由使用 CRISPR 介导的基因组编辑引入致癌 Eml4-Alk 融合蛋白驱动。在小鼠中,仅倒位就足以驱动肿瘤发生,而在 NMR 肺中,仅倒位不足以驱动肿瘤发生,肿瘤发展需要额外缺失抑癌基因 p53 和 pRb。我们的发现表明,NMR 所提出的对癌症发展的“抗性”可能反映了肿瘤起始机制,这些机制是 l
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL30845、10181。本站分类:肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE305565
【使用注意】
· 源站最后修改于 Nov 18 202,引用时请注意版本时效。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE305565
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
越来越多的人关注于理解不同物种间癌症发病率差异的机制。裸鼹鼠(NMR)常被视为“抗癌”物种,以往研究集中于识别解释这一现象的具体机制。然而,体内评估这些机制的努力仍然有限。在此,我们提供证据表明,裸鼹鼠可作为一种新型的原发性肺癌发生模型,该模型通过CRISPR介导的基因组编辑引入致癌的Eml4-Alk融合蛋白而驱动。在小鼠中,仅该基因倒位就足以驱动肿瘤发生,而在裸鼹鼠肺部,仅基因倒位不足以驱动肿瘤形成,肿瘤发展还需额外丧失肿瘤抑制因子p53和pRb。我们的发现提示,裸鼹鼠对癌症发展的所谓“抵抗力”可能反映了与人类细胞中相似肿瘤起始机制的存在。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失?
依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。




