IL17D过表达与对照H460细胞的ATAC-seq
该数据集为IL17D过表达与对照H460细胞的ATAC-seq数据,来源于NCBI GEO,属于肿瘤/肺癌方向。研究通过构建稳定过表达IL17D的H460细胞系并进行ATAC-seq分析,评估染色质可及性变化,以探究IL17D在非小细胞肺癌细胞铁死亡中的调控作用

基本信息
资源简介
IL17D过表达与对照H460细胞的ATAC-seq
ATAC-seq of IL17D-overexpressing and control H460 cells
该数据集为IL17D过表达与对照H460细胞的ATAC-seq数据,来源于NCBI GEO,属于肿瘤/肺癌方向。研究通过构建稳定过表达IL17D的H460细胞系并进行ATAC-seq分析,评估染色质可及性变化,以探究IL17D在非小细胞肺癌细胞铁死亡中的调控作用。数据包含1个文件,样例为GSE305406_series_matrix.txt.gz,主题涉及基因组结合/占据高通量测序,物种为人(9606),平台为GPL34284。可用于分析IL17D对染色质开放状态的影响及相关调控机制研究(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Aug 13 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):为探究IL17D在非小细胞肺癌(NSCLC)细胞铁死亡中的调控作用,我们构建了稳定过表达IL17D的H460细胞系,并开展ATAC-seq分析以评估染色质可及性变化。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL34284、9606。本站分类:肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE305406
【使用注意】
· 源站最后修改于 Aug 28 202,引用时请注意版本时效。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE305406
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
为探究IL17D在非小细胞肺癌(NSCLC)细胞铁死亡中的调控作用,我们构建了稳定过表达IL17D的H460细胞系,并进行了ATAC-seq分析以评估染色质可及性变化。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




