IL17D过表达与对照H460细胞的ATAC-seq

该数据集为IL17D过表达与对照H460细胞的ATAC-seq数据,来源于NCBI GEO,属于肿瘤/肺癌方向。研究通过构建稳定过表达IL17D的H460细胞系并进行ATAC-seq分析,评估染色质可及性变化,以探究IL17D在非小细胞肺癌细胞铁死亡中的调控作用

geo
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基因组分类GPL342849606
GSE305406: ATAC-seq of IL17D-overexpressing and control H460 cells

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

IL17D过表达与对照H460细胞的ATAC-seq

ATAC-seq of IL17D-overexpressing and control H460 cells

该数据集为IL17D过表达与对照H460细胞的ATAC-seq数据,来源于NCBI GEO,属于肿瘤/肺癌方向。研究通过构建稳定过表达IL17D的H460细胞系并进行ATAC-seq分析,评估染色质可及性变化,以探究IL17D在非小细胞肺癌细胞铁死亡中的调控作用。数据包含1个文件,样例为GSE305406_series_matrix.txt.gz,主题涉及基因组结合/占据高通量测序,物种为人(9606),平台为GPL34284。可用于分析IL17D对染色质开放状态的影响及相关调控机制研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Aug 13 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):为探究IL17D在非小细胞肺癌(NSCLC)细胞铁死亡中的调控作用,我们构建了稳定过表达IL17D的H460细胞系,并开展ATAC-seq分析以评估染色质可及性变化。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL34284、9606。本站分类:肿瘤/肺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE305406

【使用注意】

· 源站最后修改于 Aug 28 202,引用时请注意版本时效。

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    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

为探究IL17D在非小细胞肺癌(NSCLC)细胞铁死亡中的调控作用,我们构建了稳定过表达IL17D的H460细胞系,并进行了ATAC-seq分析以评估染色质可及性变化。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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