Sox2激活对小鼠肺肿瘤转录组谱的影响
该数据集来自 NCBI GEO，研究 Sox2 激活在小鼠肺肿瘤发生过程中对转录组的影响。实验使用 CRISPRa 可用的 PPKS 小鼠，通过携带 Sox2 靶向或非靶向 sgRNA 的慢病毒感染，在生存终点收集肿瘤并进行 RNA-seq，以评估转录组重编程
基本信息
资源简介
Sox2激活对小鼠肺肿瘤转录组谱的影响
Effect of Sox2-activation on transcriptomic profiles of murine lung tumors
该数据集来自 NCBI GEO，研究 Sox2 激活在小鼠肺肿瘤发生过程中对转录组的影响。实验使用 CRISPRa 可用的 PPKS 小鼠，通过携带 Sox2 靶向或非靶向 sgRNA 的慢病毒感染，在生存终点收集肿瘤并进行 RNA-seq，以评估转录组重编程。数据包含 1 个文件，主题标签涉及高通量测序表达谱分析，可用于探索 Sox2 在肺癌中的调控作用及潜在分子机制（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Aug 11 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：为了研究 Sox2 激活在肺肿瘤发生过程中的作用，我们用携带 Sox2 靶向或非靶向 sgRNA 的 CMV-Cre/U6-sgRNA(MS2) 编码慢病毒处理了 CRISPRa 可用的 PPKS (KRAS(LSL-G12D//wt); TP53(flox/flox); Rosa26(LSL-SAM/wt)) 小鼠。在生存终点收集肿瘤，并用 RNA-seq 评估转录组重编程。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL34290、10090。本站分类：肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE305193
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jul 29 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
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- OpenDataLab:
数据说明
为研究肺肿瘤发生过程中Sox2激活的作用，我们用携带Sox2靶向或非靶向sgRNA的CMV-Cre/U6-sgRNA(MS2)编码慢病毒处理了具备CRISPRa能力的PPKS（KRAS(LSL-G12D//wt)；TP53(flox/flox)；Rosa26(LSL-SAM/wt)）小鼠。在生存终点收集肿瘤，并通过RNA-seq评估转录组重编程。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托三甲直采网络，提供合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
