A549细胞对地塞米松响应的转录组分析：光控GR降解的GR-PhotoPROTACs

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE304966

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

糖皮质激素受体（GR）信号通路经地塞米松（Dex）激活后，可诱导非小细胞肺癌（NSCLC）细胞进入可逆的休眠状态，从而导致治疗耐药。为实现对GR活性的精准调控，我们开发了光开关PROTAC（PhotoPROTAC），其整合了芳基偶氮吡唑骨架，可实现对GR降解的可逆、波长特异性控制。将A549肺癌细胞与PhotoPROTAC KH-5-309或KH-5-306的活性形式（E-异构体）或非活性形式（Z-异构体）共孵育12小时，并在最后2小时加入Dex。RNA测序显示，KH-5-309的E-异构体可选择性地破坏GR驱动的休眠相关基因表达，而Z-异构体则保持功能惰性。该数据集为理解GR介导的休眠提供了资源，并证明了光响应化学工具在时空控制应激激素受体信号以破坏癌细胞休眠方面的实用性。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。