DMAP1通过维持复制叉稳定性并抑制IFN信号介导的抗肿瘤免疫促进肺癌进展 [RNA-seq]
该数据集来自NCBI GEO,标题为DMAP1通过维持复制叉稳定性并抑制IFN信号介导的抗肿瘤免疫促进肺癌进展的RNA-seq数据
![GSE304428: DMAP1 promotes lung cancer progression by maintaining replication fork stability and suppressing IFN signaling-mediated anti-tumor immunity [RNA-seq]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/74993.jpg)
基本信息
资源简介
DMAP1通过维持复制叉稳定性并抑制IFN信号介导的抗肿瘤免疫促进肺癌进展 [RNA-seq]
DMAP1 promotes lung cancer progression by maintaining replication fork stability and suppressing IFN signaling-mediated anti-tumor immunity [RNA-seq]
该数据集来自NCBI GEO,标题为DMAP1通过维持复制叉稳定性并抑制IFN信号介导的抗肿瘤免疫促进肺癌进展的RNA-seq数据。数据包含1个文件GSE304428_series_matrix.txt.gz,基于高通量测序进行表达谱分析,物种为小鼠(10090),平台为GPL24247。研究通过CRISPR敲除筛选发现DMAP1是肿瘤进展的关键调控因子,其缺失可抑制肿瘤细胞增殖并激活T细胞介导的适应性抗肿瘤免疫,机制涉及复制叉阻滞、基因组不稳定及内源性DNA损伤,进而激活肿瘤内在免疫信号。该数据可用于探索DMAP1在肺癌中的功能及免疫调控机制(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Aug 04 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):尽管靶向治疗和免疫治疗取得了重大进展,肺癌仍然是癌症相关死亡的主要原因,凸显了对新型治疗策略的迫切需求。通过基于CRISPR的敲除筛选,我们鉴定出DNA甲基转移酶1相关蛋白1(DMAP1)是肿瘤进展的关键调控因子。功能研究表明,DMAP1缺失通过减弱肿瘤细胞增殖和激活T细胞介导的适应性抗肿瘤效应发挥其抗肿瘤作用。机制上,DMAP1缺失导致复制叉阻滞,扰乱基因组稳定性,并诱导内源性DNA损伤,从而在癌细胞生长过程中激活肿瘤内在免疫信号并增强抗肿瘤免疫应答。临床数据分析显示,高DMAP1表达与免疫浸润减少、一种“冷”肿瘤
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24247、10090。本站分类:肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE304428
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jun 24 202,引用时请注意版本时效。
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
尽管靶向治疗和免疫治疗取得了实质性进展,肺癌仍然是癌症相关死亡的主要原因,凸显了对新型治疗策略的迫切需求。通过基于CRISPR的敲除筛选,我们鉴定出DNA甲基转移酶1相关蛋白1(DMAP1)是肿瘤进展的关键调控因子。功能研究表明,DMAP1缺失通过减弱肿瘤细胞增殖和激活T细胞介导的适应性抗肿瘤效应发挥其抗肿瘤作用。在机制上,DMAP1缺失导致复制叉阻滞、扰乱基因组稳定性并诱导内源性DNA损伤,从而在癌细胞生长过程中激活肿瘤内在免疫信号并增强抗肿瘤免疫应答。临床数据分析显示,DMAP1高表达与免疫浸润减少、“冷”肿瘤微环境以及肺癌患者较差的总生存期相关。这些发现显著推进了我们对DMAP1在肺癌发生发展中功能的认识,并为设计新型治疗方法提供了科学依据。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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