肺癌中肿瘤相关巨噬细胞状态与非保守lncRNA的关联

TAM 是肿瘤微环境的核心参与者,可快速适应环境变化并呈现多种功能表型,但其功能可塑性的调控机制尚不完全清楚;lncRNA 作为表观遗传和转录后过程的关键调控因子,被认为可能参与 TAM 极化

geo
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基因组分类GPL1905710090
GSE302249: Association of Tumour-Associated Macrophage States with Non-conserved lncRNAs in Lung Cancer

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-08

资源简介

肺癌中肿瘤相关巨噬细胞状态与非保守lncRNA的关联

Association of Tumour-Associated Macrophage States with Non-conserved lncRNAs in Lung Cancer

该数据集来自 NCBI GEO,标题为 Association of Tumour-Associated Macrophage States with Non-conserved lncRNAs in Lung Cancer,聚焦肺癌中肿瘤相关巨噬细胞(TAM)状态与非保守 lncRNA 的关联。TAM 是肿瘤微环境的核心参与者,可快速适应环境变化并呈现多种功能表型,但其功能可塑性的调控机制尚不完全清楚;lncRNA 作为表观遗传和转录后过程的关键调控因子,被认为可能参与 TAM 极化。数据包含 1 个文件 GSE302249_series_matrix.txt.gz,采用高通量测序进行表达谱分析,可用于研究 TAM 状态相关 ln。

【数据集背景】

源站首次发布:Jul 10 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):肿瘤相关巨噬细胞(TAM)是肿瘤微环境中的核心参与者,驱动癌症进展并调节免疫反应。TAM 以其快速适应环境变化的能力而闻名,能够呈现广泛的功能表型。然而,这种功能可塑性背后的调控机制仍未完全清楚。长链非编码 RNA(lncRNA)作为表观遗传和转录后过程的关键调控因子,其在 TAM 极化中的潜在作用日益受到认可。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL19057、10090。本站分类:肿瘤/肺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE302249

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jan 27 202,引用时请注意版本时效。

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数据说明

肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)是肿瘤微环境中的核心参与者,驱动癌症进展并调节免疫反应。TAMs以其快速适应环境变化的能力而闻名,能够呈现出多种功能表型。然而,这种功能可塑性背后的调控机制仍未完全阐明。长链非编码RNA(lncRNAs)作为表观遗传和转录后过程的关键调控因子,其在TAM极化中的潜在作用日益受到认可。在本研究中,我们对来源于小鼠和人类肺癌的TAMs中的lncRNA表达进行了全面的比较分析。尽管我们通过正交的计算机模拟方法鉴定出一小群小鼠lncRNAs可能是人类直系同源物,但大多数小鼠lncRNAs缺乏明确的人类对应物。总体而言,我们的研究结果揭示了小鼠和人类肺癌TAMs中lncRNA表达的显著差异,强调了利用基于人类的模型来深入研究lncRNAs在免疫调控中的作用以及弥合小鼠与人类癌症免疫学之间转化鸿沟的重要性。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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