POU2F3 与 OCA-T1/OCA-T2 的 DNA 依赖性共激活因子招募结构基础 [DMS_Screen]

该数据集来自 NCBI GEO,聚焦小细胞肺癌中 POU2F3 依赖的转录调控机制。研究通过晶体结构解析 POU2F3 与 OCA-T1 或 OCA-T2 及 DNA 形成的三元界面,并采用深度突变扫描评估 POU2F3 和 OCA-T1 中 4,218 个错义变体的功能影响,识别突变敏感热点和结构

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基因组预测OtherGPL301739606
GSE302004: Structural Basis of DNA-Dependent Coactivator Recruitment by the Tuft Cell Master Regulator POU2F3 [DMS_Screen]

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-12

资源简介

POU2F3 与 OCA-T1/OCA-T2 的 DNA 依赖性共激活因子招募结构基础 [DMS_Screen]

Structural Basis of DNA-Dependent Coactivator Recruitment by the Tuft Cell Master Regulator POU2F3 [DMS_Screen]

该数据集来自 NCBI GEO,聚焦小细胞肺癌中 POU2F3 依赖的转录调控机制。研究通过晶体结构解析 POU2F3 与 OCA-T1 或 OCA-T2 及 DNA 形成的三元界面,并采用深度突变扫描评估 POU2F3 和 OCA-T1 中 4,218 个错义变体的功能影响,识别突变敏感热点和结构约束区域。数据可用于分析肿瘤细胞适应性的关键位点,支持肺癌分子分型与靶点可成药性研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jul 08 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):转录因子 POU2F3 定义了簇细胞(tuft cell)的身份,并构成小细胞肺癌(SCLC)的一个独特分子亚型。尽管 POU2F3 被认为不可成药,但其活性关键依赖于共激活因子 OCA-T1 和 OCA-T2。在此,我们证明急性抑制 POU2F3 或 OCA-T1 均可在体内诱导簇细胞样 SCLC 异种移植瘤消退。为探索这种依赖性的结构基础和可成药性,我们解析了 POU2F3 与 OCA-T1 或 OCA-T2 及 DNA 形成复合物的晶体结构,揭示了一个三方的、DNA 依赖性界面。我们进一步采用深度突变扫描,系统评估了 POU2F3 和 OCA-T1 中 4,218 个错义变体的功能影响,发现了突变敏感热点和对肿瘤细胞适应性至关重要的结构约束区域。这些发现定义了一个独特的转录复合

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:Other、GPL30173、9606。本站分类:肿瘤/肺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE302004

【使用注意】

· 源站最后修改于 Feb 04 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

The transcription factor POU2F3 defines the identity of tuft cells and underlies a distinct molecular subtype of small cell lung cancer (SCLC). Although POU2F3 is considered undruggable, its activity critically depends on the coactivators OCA-T1 and OCA-T2. Here, we demonstrate that acute suppression of either POU2F3 or OCA-T1 induces regression of tuft cell-like SCLC xenografts in vivo. To explore the structural basis and druggability of this dependency, we solved crystal structures of POU2F3 bound to OCA-T1 or OCA-T2 in complex with DNA, revealing a tripartite, DNA-dependent interface. We further employed deep mutational scanning to systematically assess the functional impact of 4,218 missense variants in POU2F3 and OCA-T1, uncovering both mutation-sensitive hotspots and structurally constrained regions critical for tumor cell fitness. These findings define a unique transcriptional complex that integrates DNA recognition with coactivator recruitment and nominate POU2F3–OCA-T as a structurally tractable vulnerability in tuft cell-like carcinomas.

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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