DNAmBERT：基于Transformer的DNA序列与甲基化数据无创癌症诊断模型
该数据集来自NCBI，包含55个样本的游离DNA简化代表性亚硫酸氢盐测序（cfRRBS）数据，其中7例早期肺癌、41例晚期肺癌和7例非恶性对照，用于识别早期肺癌检测标志物
基本信息
资源简介
DNAmBERT：基于Transformer的DNA序列与甲基化数据无创癌症诊断模型
DNAmBERT: A Transformer-Based Model for Robust, Non-Invasive Cancer Diagnosis Using DNA Sequence and Methylation Data
该数据集来自NCBI，包含55个样本的游离DNA简化代表性亚硫酸氢盐测序（cfRRBS）数据，其中7例早期肺癌、41例晚期肺癌和7例非恶性对照，用于识别早期肺癌检测标志物。数据以高通量测序甲基化谱形式提供，配套文件为GSE301266_series_matrix.txt.gz。该数据可用于肺癌早期无创诊断相关的分类建模与甲基化标志物挖掘研究（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Jun 30 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：我们生成了55个样本的游离DNA简化代表性亚硫酸氢盐测序（cfRRBS）数据（7例早期肺癌、41例晚期肺癌和7例非恶性对照），以识别用于早期肺癌检测的标志物。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL16791、9606。本站分类：肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE301266
【使用注意】
· 源站最后修改于 Sep 25 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE301266
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
我们为55个样本（7例早期肺癌、41例晚期肺癌和7例非恶性对照）生成了无细胞简化代表性亚硫酸氢盐测序（cfRRBS）数据，以识别用于早期肺癌检测的标志物。Briefings in Bioinformatics，第27卷，第5期，2026年9月，bbag455，https://doi.org/10.1093/bib/bbag455。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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