GSE301232：CircROBO2通过miR-625-5p/PDGFB介导的MAPK激活调控非小细胞肺癌奥希替尼耐药

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE301232

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数据说明

背景：获得性奥希替尼耐药的出现是非小细胞肺癌（NSCLC）治疗中面临的巨大挑战。尽管环状RNA（circRNA）日益被认为是化疗耐药的关键调控因子，但其在奥希替尼耐药机制中的具体作用仍鲜有阐明。方法：我们通过长期药物暴露建立了奥希替尼耐药的NSCLC细胞系（HCC4006OR），并进行了全面的转录组测序以鉴定差异表达的circRNA。我们利用一系列细胞和分子生物学方法，系统研究了circROBO2的分子特征和功能意义。我们采用先进的分子动力学模拟来阐明PDGFB与奥希替尼之间潜在的分子相互作用。结果：我们发现circROBO2在奥希替尼耐药的HCC4006OR细胞中显著上调。功能研究表明，在奥希替尼处理下，circROBO2可增强细胞存活、增殖和侵袭能力，同时抑制细胞凋亡。

在机制上，circROBO2作为miR-625-5p的分子海绵，导致PDGFB表达升高，进而激活MAPK通路，特别是RAF/MEK/ERK级联反应。通过敲低circROBO2或过表达miR-625-5p靶向该通路，可部分恢复耐药细胞对奥希替尼的敏感性。分子动力学模拟提示PDGFB与奥希替尼之间可能存在直接相互作用，为耐药机制提供了额外见解。结论：我们的研究揭示了奥希替尼耐药中一种新的circROBO2/miR-625-5p/PDGFB调控轴，并将circROBO2定位为NSCLC治疗的潜在治疗靶点和生物标志物。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。