吸烟者可切除非小细胞肺癌肿瘤浸润自然杀伤细胞图谱用于治疗分层

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE300685

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数据说明

目的：新辅助化学免疫治疗已改善可切除非小细胞肺癌（NSCLC）的结局，但其在真实世界中的实施常因手术延迟、取消、免疫相关纤维化及术后并发症增加而面临挑战。吸烟的NSCLC患者尽管术后并发症风险较高，但对新辅助化学免疫治疗的反应增强。本研究旨在识别与吸烟相关的免疫细胞决定因素，以指导治疗策略。方法：对来自非吸烟者、吸烟者及慢性阻塞性肺疾病（COPD）患者的61份肺样本，以及8例浸润性肺腺癌进行单细胞RNA测序，以界定吸烟相关免疫特征。利用来自102例切除的NSCLC和24例接受新辅助化学免疫治疗的NSCLC患者的RNA测序数据，我们进行了计算机模拟去卷积，以评估细胞组成与临床结局之间的关联。结果：在140种肺细胞表型中，两个自然杀伤（NK）细胞亚群与吸烟及COPD严重程度密切相关。

“应激反应性NK（NKSR）细胞”表现出未成熟特征和细胞因子反应性特征。“耗竭型NK（NKExh）细胞”表现出成熟特征以及多种免疫检查点表达升高（PDCD1、TIGIT和LAG3）。瘤内NKSR细胞丰富与手术后生存率显著改善相关，尤其是在当前吸烟者中。相反，NKSR低且NKExh高的肿瘤特征与对新辅助化疗免疫治疗更好的应答相关。结论：肿瘤浸润NK细胞表型分析可能有助于吸烟NSCLC患者的治疗分层。NKSR细胞保留预示 upfront 手术预后良好，而NKExh细胞富集则表明从新辅助化疗免疫治疗中获益更大。这些特征可能有助于通过平衡治疗获益和r来优化治疗

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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