靶向硫氧还蛋白还原酶1(TrxR1)揭示肺癌中铁死亡相关转录脆弱性

该数据集来自 NCBI GEO,标题为靶向 TrxR1 揭示肺癌中铁死亡相关转录脆弱性。研究通过 bulk RNA 测序,比较对 TrxR1 抑制剂 CS47 和 auranofin 敏感的 KRAS-WT 与 EGFR-MUT 肺癌细胞,以及耐药的 KRAS-MUT 细胞在转录层面的差异

geo
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基因组分类GPL185739606
GSE300378: Targeting Thioredoxin Reductase 1 (TrxR1) Uncovers Ferroptosis-Linked Transcriptional Vulnerabilities in Lung Cancer

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

靶向硫氧还蛋白还原酶1(TrxR1)揭示肺癌中铁死亡相关转录脆弱性

Targeting Thioredoxin Reductase 1 (TrxR1) Uncovers Ferroptosis-Linked Transcriptional Vulnerabilities in Lung Cancer

该数据集来自 NCBI GEO,标题为靶向 TrxR1 揭示肺癌中铁死亡相关转录脆弱性。研究通过 bulk RNA 测序,比较对 TrxR1 抑制剂 CS47 和 auranofin 敏感的 KRAS-WT 与 EGFR-MUT 肺癌细胞,以及耐药的 KRAS-MUT 细胞在转录层面的差异。结果显示,敏感细胞在 TrxR 抑制后发生广泛转录重编程,谷胱甘肽合成、抗氧化防御和铁代谢被显著激活,但该适应反应最终失衡并引发铁死亡。数据可用于研究肺癌 TrxR1 抑制的转录响应、铁死亡机制及耐药差异(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jun 20 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):Bulk RNA 测序显示,对 TrxR1 抑制剂(CS47 和 auranofin)敏感的 KRAS-WT 和 EGFR-MUT 肺癌细胞发生广泛的转录重编程,而耐药的 KRAS 突变型(KRAS-MUT)细胞则不然。在 KRAS-WT 肺癌细胞中,TrxR 抑制触发谷胱甘肽生物合成、抗氧化防御和铁代谢的强烈转录激活。这种适应性反应虽然旨在维持氧化还原平衡,但最终被压垮,导致铁死亡性细胞死亡。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL18573、9606。本站分类:肿瘤/肺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE300378

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jun 30 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

bulk RNA测序显示,对TrxR1抑制剂(CS47和金诺芬)敏感的KRAS-WT和EGFR-MUT肺癌细胞经历了广泛的转录重编程,这与治疗耐药的KRAS突变(KRAS-MUT)细胞不同。TrxR抑制在KRAS-WT肺癌细胞中触发了谷胱甘肽生物合成、抗氧化防御和铁代谢的强烈转录激活。这种适应性反应虽然旨在维持氧化还原平衡,但最终被压垮,导致铁死亡性细胞死亡。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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