PKM2缺失诱导脂肪酸生物合成激活限制非小细胞肺癌对Osimertinib的响应

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE300311

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

非小细胞肺癌（NSCLC）——最常见的肺癌类型——是一种侵袭性恶性肿瘤，有效治疗选择有限1。奥希替尼作为第三代表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂（EGFR-TKI），已彻底改变了EGFR突变型NSCLC的治疗格局，然而耐药性显著限制了其临床获益2。本研究通过全基因组遗传筛选发现，丙酮酸激酶M2（PKM2）是奥希替尼耐药的新型调控因子。PKM2缺失以不依赖糖酵解的方式触发脂肪酸生物合成激活。我们发现PKM2在胞质中与KDM1A相互作用，且在PKM2敲除细胞和奥希替尼耐受细胞中，KDM1A的核转位均增加。机制上，KDM1A对关键脂质合成酶——脂肪酸合酶（FASN）启动子区域的H3K9me3进行去甲基化，并与转录因子AP-2协同激活FASN转录，从而赋予奥希替尼耐药性。通过奥利司他对FASN进行药理学抑制，可在体外和体内奥希替尼耐药模型中诱导与奥希替尼的合成致死效应。

9例对奥希替尼无反应的NSCLC患者接受奥希替尼联合奥利司他治疗后，出现了有意义的临床反应。我们的数据突显了代谢脆弱性，并为治疗TKI耐药的NSCLC提供了潜在的治疗方法。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。