GSE299060:阐明KRT19促进NSCLC进展的机制 [PC-9细胞_RNA-Seq]
该数据集来自NCBI GEO,标题为阐明KRT19促进NSCLC进展的机制,聚焦PC-9细胞系的RNA-Seq表达谱。KRT19是酸性I型细胞角蛋白家族成员,参与中间丝细胞骨架形成,在多种癌症中异常表达,并可通过与受体、衔接蛋白、效应物和激酶等分子互作介导细胞周期阻滞和肿瘤干细胞重编程
![GSE299060: Elucidating the mechanisms underlying KRT19 contributes to NSCLC progression [PC-9 cells_RNA-Seq]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/81991.jpg)
基本信息
资源简介
GSE299060:阐明KRT19促进NSCLC进展的机制 [PC-9细胞_RNA-Seq]
Elucidating the mechanisms underlying KRT19 contributes to NSCLC progression [PC-9 cells_RNA-Seq]
该数据集来自NCBI GEO,标题为阐明KRT19促进NSCLC进展的机制,聚焦PC-9细胞系的RNA-Seq表达谱。KRT19是酸性I型细胞角蛋白家族成员,参与中间丝细胞骨架形成,在多种癌症中异常表达,并可通过与受体、衔接蛋白、效应物和激酶等分子互作介导细胞周期阻滞和肿瘤干细胞重编程。为阐明KRT19在非小细胞肺癌进展中的作用及机制,研究者对PC-9细胞系进行RNA-Seq以鉴定其靶基因。数据包含1个文件GSE299060_series_matrix.txt.gz,可用于分析KRT19相关靶基因与表达变化(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Jun 05 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):作为酸性I型细胞角蛋白家族的一员,角蛋白19(KRT19)最初被认为形成中间丝细胞骨架,负责结构刚性和多功能支架。KRT19在多种癌症中异常表达,包括肝细胞癌、乳腺癌、浆液性卵巢囊腺癌等。已有研究揭示KRT19通过与受体、衔接蛋白、效应物和激酶等细胞分子相互作用,介导细胞周期阻滞和肿瘤干细胞重编程。越来越多的证据表明KRT19在肺癌中具有临床意义,需要广泛研究来阐明KRT19在NSCLC进展中的作用和潜在机制,我们对PC-9细胞系进行了RNA-Seq以鉴定其靶基因。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL34284、9606。本站分类:肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE299060
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jan 21 202,引用时请注意版本时效。
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
作为酸性I型细胞角蛋白家族的一员,角蛋白19(KRT19)最初被认为构成中间丝细胞骨架,负责结构刚性和多功能支架。KRT19在包括肝细胞癌、乳腺癌、浆液性卵巢囊腺癌等多种癌症中异常表达。研究表明,KRT19通过与细胞分子如受体、衔接蛋白、效应器和激酶相互作用,介导细胞周期停滞和癌症干细胞重编程。越来越多的证据说明了KRT19在肺癌中的临床意义,为了阐明KRT19在非小细胞肺癌进展中的作用及其潜在机制,我们进行了RNA-Seq以鉴定其在PC-9细胞系中的靶基因。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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