MET TKI 耐药 Hs746T 细胞表达谱
研究通过剂量递增策略在 METΔex14 依赖的癌细胞中生成 MET-TKI 难治性同源细胞,靶向测序发现耐药克隆获得 SPOP 和 MGA 突变,二者均为 MYC 活性拮抗因子,其互作组分析提示 MYC 是共享靶点,突变克隆表现出高 MYC 水平和 MYC 激活转录特征

基本信息
资源简介
MET TKI 耐药 Hs746T 细胞表达谱
Expression profiling of MET TKI resistant Hs746T cells.
该数据集为 MET TKI 耐药 Hs746T 细胞的表达谱数据,来源于 NCBI GEO,包含 1 个文件 GSE298399_series_matrix.txt.gz。研究通过剂量递增策略在 METΔex14 依赖的癌细胞中生成 MET-TKI 难治性同源细胞,靶向测序发现耐药克隆获得 SPOP 和 MGA 突变,二者均为 MYC 活性拮抗因子,其互作组分析提示 MYC 是共享靶点,突变克隆表现出高 MYC 水平和 MYC 激活转录特征。数据可用于研究 MET-TKI 耐药机制及 MYC 相关信号通路(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:May 28 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):MET 外显子 14 跳跃突变(METΔex14)是约 3-5% 肺癌的致癌驱动因素,可用 MET 酪氨酸激酶抑制剂(TKI)靶向治疗。耐药的出现限制了长期缓解,且通常由继发性基因组改变介导。我们设计了一种临床前策略,利用一种新的剂量递增方法在 METΔex14 依赖性癌细胞上研究 MET-TKI 耐药,以生成 MET-TKI 难治性同源对应细胞。对耐药克隆的靶向测序鉴定出 SPOP 和 MGA 的获得性突变,二者均为 MYC 活性的拮抗剂。对 SPOP 和 MGA 互作组的进一步研究证实 MYC 是其调控网络之间最可能共享的靶点。SPOP 和 MGA 突变克隆表现出高 MYC 水平和 MYC 激活的转录组特征。在 TKI 存在下,MYC 的异位表达挽救了肿瘤生长,而 MYC 的耗竭
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL17692、9606。本站分类:肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE298399
【使用注意】
· 源站最后修改于 May 21 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
MET外显子14跳跃突变(METΔex14)是约3-5%肺癌的致癌驱动因素,可通过MET酪氨酸激酶抑制剂(TKIs)进行靶向治疗。耐药性的出现限制了长期疗效,且通常由继发性基因组改变所介导。我们设计了一种临床前策略,利用新型剂量递增方法在依赖METΔex14的癌细胞上研究MET-TKI耐药性,以生成MET-TKI难治性的同源细胞模型。对耐药克隆的靶向测序发现了SPOP和MGA的获得性突变,两者均为MYC活性的拮抗剂。对SPOP和MGA相互作用组的进一步研究证实,MYC是其调控网络之间最可能的共同靶点。SPOP和MGA突变克隆表现出高MYC水平和MYC激活的转录组特征。在TKI存在的情况下,MYC的异位表达恢复了肿瘤生长,而MYC的耗竭则模拟了TKI治疗的细胞毒性效应,表明MYC活性与MET信号传导相耦合,且MYC是介导耐药性所必需的。
对METΔex14阳性肺癌临床队列的分析揭示,有几个案例中获得的MYC通路改变介导了对MET-TKIs的耐药性。这些发现共同指向MYC是MET TKI耐药癌症进展的关键通路,并且我们的体外数据支持联合靶向MYC和MET的策略,以期在METΔex14阳性肺癌患者中实现更持久的响应。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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