衰老抑制致癌KRAS驱动的肺肿瘤发生并改变肿瘤抑制

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE297023

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

大多数癌症在六十岁以上人群中确诊，但年龄如何影响肿瘤发生尚知之甚少。衰老伴随突变积累——普遍认为这 contributed to cancer risk——同时也与众多可能影响肿瘤发生的其他细胞和分子变化相关。此外，癌症发病率在人群中最年长的部分有所下降，提示高龄可能降低致癌作用。在此，我们展示在人类肺癌的基因工程小鼠模型中，衰老抑制致癌性KRAS驱动的肿瘤起始和生长。此外，衰老减弱了失活许多（但非全部）肿瘤抑制基因的影响，其中失活PTEN——PI3K/AKT通路的负调控因子——的影响被削弱至不成比例的程度。单细胞转录组分析揭示，老年小鼠肿瘤中的肿瘤细胞保留了许多与年龄相关的转录组变化，表明年龄具有持久影响，且该影响贯穿于致癌转化过程。

此外，PTEN失活的后果显著依赖于年龄，PTEN缺陷减少了癌细胞和肿瘤微环境中的衰老特征。我们的发现表明，年龄与肺癌发病率之间的关系可能反映了驱动突变积累与衰老的肿瘤抑制效应之间相互竞争作用的综合结果。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。