肺腺癌脑转移高置信度细胞系数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE297016

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

肺癌是全球癌症相关死亡的主要原因之一，脑转移发生率约为30-55%，尤其在肺腺癌中更为常见。由于获取真实的脑转移肿瘤细胞存在困难，研究人员通常使用裸鼠模型建立脑转移细胞系，但传统方法存在成本高、周期长、需要专业成像设备等局限性。为解决这些问题，我们开发了一种改进方法，通过在裸鼠中进行低细胞数量的循环颅内注射（500-4000个细胞），成功建立了H1975-BM1、BM2和BM3细胞系。通过RNA测序和生物信息学分析，我们鉴定了这些细胞系之间的转录组差异，揭示H1975-BM1细胞主要表现出干细胞功能和迁移特征，而H1975-BM3细胞则显示出与相互作用相关的增强的趋化性、细胞黏附和细胞因子分泌。

实验验证，包括Transwell实验、CCK8、细胞黏附实验以及裸鼠皮下肿瘤植入，进一步证实了这些发现，其中H1975-BM3形成了更大的肿瘤和更明显的分泌囊腔。总之，我们改进的方法成功建立了高可信度的脑转移肺腺癌细胞系，阐明了脑转移进展不同阶段独特的转录组和功能特征。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。