Sox2介导肺癌中肿瘤抑制因子促进细胞内在与免疫重塑

该数据集来自NCBI GEO,标题为Sox2介导肺癌中肿瘤抑制因子促进细胞内在与免疫重塑,属于肿瘤/肺癌分类。可用于研究Sox2介导肺癌中肿瘤抑制因子对细胞内在和免疫微环境重塑的作用,支持表达谱分析与分类任务(来源 NCBI)

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geo
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基因组分类GPL2424710090
GSE295887: Tumor suppressors in Sox2-mediated lung cancers promote distinct cell-intrinsic and immunologic remodeling

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-18

资源简介

Sox2介导肺癌中肿瘤抑制因子促进细胞内在与免疫重塑

GSE295887 是一个来自 NCBI GEO 的肿瘤/肺癌分类数据集,英文标题为“Tumor suppressors in Sox2-mediated lung cancers promote distinct cell-intrinsic and immunologic remodeling”,中文可译为“Sox2 介导肺癌中的肿瘤抑制因子促进不同的细胞内在与免疫重塑”。该数据集围绕 Sox2 介导的肺癌模型,关注肿瘤抑制因子在细胞内在层面与免疫微环境层面所引发的重塑作用,属于高通量测序表达谱分析类型。数据集由 UNC Lineberger Comprehensive Cancer Center 的 Office of Genomics Research 提交,发布时间为 Apr 29 202,源站描述指出该 SuperSeries 由下列 SubSeries 组成。数据集当前提供 1 个文件,样例文件为 GSE295887_series_matrix.txt.gz,可用于表达谱分析与分类任务相关研究。

【数据集背景】

该数据集聚焦于 Sox2 介导的肺癌。Sox2 是一种在多种肿瘤中发挥重要作用的转录因子,而肿瘤抑制因子在 Sox2 驱动的肺癌发生发展过程中如何影响细胞内在状态与免疫微环境,是该数据集标题所指向的核心科学问题。源站标题明确表达了“促进不同的细胞内在与免疫重塑”这一主题,说明数据集的设计意图在于区分并刻画不同肿瘤抑制因子背景下细胞自身与免疫学层面的差异化改变。数据集归属于肿瘤/肺癌分类,来源于 ncbi.nlm.nih.gov,属于 GEO 平台上的高通量表达谱资源。

【数据内容】

数据集当前包含 1 个文件,文件样例为 GSE295887_series_matrix.txt.gz,属于系列矩阵文件形式,通常用于汇总表达谱数据。主题标签包括“Expression profiling by high throughput sequencing”,表明数据通过高通量测序进行表达谱分析;同时标注了 GPL24247 与 10090,分别对应平台编号与物种编号。源站描述说明该 SuperSeries 由下列 SubSeries 组成,意味着该数据集在结构上可能整合了多个子系列的数据内容。文件数量为 1,说明当前可获取的文件规模较为精简。

【采集与来源】

数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 NCBI GEO 数据库资源。提交者为 UNC Lineberger Comprehensive Cancer Center 的 Office of Genomics Research,发布时间为 Apr 29 202。数据集英文名与源站标题一致,均为“Tumor suppressors in Sox2-mediated lung cancers promote distinct cell-intrinsic and immunologic remodeling”。关于具体的样本采集方法、实验设计细节、测序平台运行参数等信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集可用于研究 Sox2 介导肺癌中肿瘤抑制因子对细胞内在和免疫微环境重塑的作用,支持表达谱分析与分类任务。具体而言,研究者可基于该数据探索不同肿瘤抑制因子状态下基因表达层面的差异,以及这些差异如何对应细胞内在变化与免疫学改变。由于主题标签涉及高通量测序表达谱分析,该数据适合用于转录组水平的比较分析与模式识别任务。关于更细化的适用场景,源站未提供。

【使用方法】

使用该数据集时,可下载数据文件 GSE295887_series_matrix.txt.gz,按文件格式读取,该文件为 GZIP 压缩包。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入,以避免因字段解析或编码不一致导致的分析偏差。关于具体的分析流程、软件工具与参数设置,源站未提供。

【质量与限制】

数据集当前仅提供 1 个文件,文件样例为系列矩阵文件,关于数据质量评估、缺失值情况、批次效应等信息,源站未提供。由于源站描述仅说明该 SuperSeries 由下列 SubSeries 组成,未展开各子系列的具体内容,使用者在整合分析时需注意数据层级关系。关于样本量、重复数、对照设置等实验设计信息,源站未提供。

【引用与许可】

数据集的作者为 Office of Genomics Research,UNC Lineberger Comprehensive Cancer Center,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于引用格式与许可条款的具体信息,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE295887

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.

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