Sotorasib在KRAS G12C突变非小细胞肺癌中临床疗效的分子决定因素
该数据集来自NCBI GEO，标题为Sotorasib在KRAS G12C突变非小细胞肺癌中临床疗效的分子决定因素，包含1个文件GSE295032_series_matrix.txt.gz，属于高通量测序表达谱数据
基本信息
资源简介
Sotorasib在KRAS G12C突变非小细胞肺癌中临床疗效的分子决定因素
GSE295032 数据集来自 NCBI GEO，标题为“Molecular Determinants of Sotorasib Clinical Efficacy in KRAS G12C–Mutated Non–Small-Cell Lung Cancer”，即关于 Sotorasib 在 KRAS G12C 突变非小细胞肺癌中临床疗效分子决定因素的研究。该数据集归入肿瘤／肺癌分类，属于高通量测序表达谱数据，共包含 1 个文件，样例文件为 GSE295032_series_matrix.txt.gz。数据集作者为 Ferdinandos Skoulidis，发布时间为 Apr 18 202。整体上，该数据集围绕非小细胞肺癌的转录特征展开，可用于了解该研究相关的表达谱信息。
【数据集背景】
该数据集源自 NCBI GEO，研究主题聚焦于 KRAS G12C 突变的非小细胞肺癌（NSCLC）中 Sotorasib 临床疗效的分子决定因素。源站描述指出，该研究描述了非鳞状非小细胞肺癌的转录亚型。由此可知，数据集所对应的研究关注非鳞状 NSCLC 在转录层面的分型特征，并将其与 Sotorasib 的临床疗效联系起来。数据集被本站归入肿瘤／肺癌分类，主题标签包括 Expression profiling by high throughput sequencing、GPL20301 和 9606，分别指向高通量测序表达谱、所用平台以及人类物种信息。
【数据内容】
数据集包含 1 个文件，文件样例为 GSE295032_series_matrix.txt.gz，属于 GZIP 压缩格式的表达谱矩阵文件。主题标签表明其数据类型为高通量测序表达谱（Expression profiling by high throughput sequencing），平台编号为 GPL20301，物种编号为 9606（人类）。源站描述仅说明该研究描述了非鳞状非小细胞肺癌的转录亚型，未提供矩阵中具体包含的样本数量、基因数量、分组信息或临床变量等细节。
【采集与来源】
数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，即 NCBI GEO 数据库。数据集作者为 Ferdinandos Skoulidis，发布时间为 Apr 18 202。数据通过高通量测序进行表达谱分析，平台信息以 GPL20301 标识。除上述来源信息外，源站未提供更详细的样本采集地点、时间跨度、测序策略或临床随访等信息。
【适用场景】
基于其主题与数据类型，该数据集适用于与非鳞状非小细胞肺癌转录亚型相关的研究场景，以及围绕 KRAS G12C 突变 NSCLC 中 Sotorasib 疗效分子决定因素的表达谱分析。主题标签显示其为高通量测序表达谱数据，可用于表达层面的探索性分析。具体分析目标、统计方法和验证设计应结合研究问题确定；源站未提供针对该数据集的具体应用建议。
【使用方法】
使用时可先下载数据文件 GSE295032_series_matrix.txt.gz，按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入。由于数据集仅包含 1 个矩阵文件，读取时应关注文件内的字段结构、样本标识与表达值编码方式。源站未提供额外的预处理步骤、标准化方法或分析流程说明。
【质量与限制】
数据集仅包含 1 个文件，且为系列矩阵文件，源站未提供原始测序数据、样本元数据明细或质量控制指标。源站描述较为简短，仅说明研究描述了非鳞状非小细胞肺癌的转录亚型，未给出样本量、临床信息、统计结果等细节。因此，使用时应以文件内实际内容为准，并在小样本核对阶段确认字段与编码的完整性。源站未提供关于数据质量评估的更多信息。
【引用与许可】
数据集作者为 Ferdinandos Skoulidis，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。源站未提供具体的引用格式、发表文献信息或数据使用许可条款，使用前应参考 NCBI GEO 的相关政策与源站页面说明。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE295032
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本研究描述了非鳞状非小细胞肺癌（NSCLC）的转录亚型。采用全转录组RNA检测（Tempus RS.v2；Tempus Labs, Inc.，美国伊利诺伊州芝加哥）对基线组织样本（新鲜/存档）进行分析。研究目标包括表征KRAS G12C受试者群体在基因突变（ATM、SMARCA4、KEAP1、STK11）及转录特征方面的表达情况：KPCL（Skoulidis, Cancer Discov (2015) 5 (8): 860–877）与NRF2激活（Singh, Clin Cancer Res (2021) 27 (3): 877–888）。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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