HNF4a 调控 IMA 生长、身份及对 KRAS 抑制的响应

可用于研究 HNF4a 对 IMA 生长、细胞身份维持及 KRAS 抑制应答的调控作用,支持表达谱层面的分类与机制探索(来源 NCBI)

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基因组分类GPL242479606
GSE294573: HNF4a controls growth, identity and response to KRAS inhibition in IMA.

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

HNF4a 调控 IMA 生长、身份及对 KRAS 抑制的响应

GSE294573 是一个聚焦于 HNF4a 在 IMA 中作用的表达谱数据集,其源站标题为“HNF4a controls growth, identity and response to KRAS inhibition in IMA.”。从标题与侧写线索来看,该数据集可用于研究 HNF4a 对 IMA 生长、细胞身份维持以及 KRAS 抑制应答的调控作用,并支持在表达谱层面开展分类与机制探索。数据集归属于肿瘤 / 肺癌方向,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,主题标签涉及高通量测序表达谱分析、GPL24247 平台以及 9606 物种标识。整体而言,该数据集为研究者提供了一个围绕 HNF4a 与 KRAS 抑制应答关系的转录组层面资源,适合用于探索 IMA 相关生物学过程与潜在调控机制。

【数据集背景】

该数据集的英文名称为 GSE294573: HNF4a controls growth, identity and response to KRAS inhibition in IMA.,源站标题与数据集英文名一致。其本站分类为肿瘤 / 肺癌,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。从标题所反映的研究主题来看,该数据集关注 HNF4a 在 IMA 中的功能,涉及生长、细胞身份维持以及对 KRAS 抑制的应答。主题标签中包含 Expression profiling by high throughput sequencing、GPL24247 和 9606,表明该数据集属于高通量测序表达谱类型,涉及特定平台与人类物种标识。作者信息为 Headtlove 与 Essel Dadzie,发布时间为 Apr 14 202。源站描述指出,该 SuperSeries 由下列 SubSeries 组成,说明其结构上可能整合了多个子系列,但源站未提供各 SubSeries 的具体构成与内容细节。

【数据内容】

该数据集的文件数量为 1,文件样例为 GSE294573_series_matrix.txt.gz。从文件命名来看,该文件应为系列矩阵文件,并以 GZIP 压缩格式提供。主题标签中的 Expression profiling by high throughput sequencing 表明数据属于高通量测序表达谱范畴,GPL24247 与 9606 分别对应平台与物种层面的标识信息。源站描述仅说明该 SuperSeries 由下列 SubSeries 组成,未进一步提供样本数量、分组设计、基因数量、表达值范围或差异分析结果等具体内容。因此,关于数据内容的具体维度、样本构成与生物学重复等信息,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 NCBI 平台上的公开数据资源。作者为 Headtlove 与 Essel Dadzie,发布时间为 Apr 14 202。主题标签中的 GPL24247 与 9606 提供了平台与物种相关的标识,但源站未提供样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、测序策略细节或数据处理流程等具体采集与来源信息。源站描述仅指出该 SuperSeries 由下列 SubSeries 组成,未展开说明各子系列的具体来源与采集方式。因此,关于样本来源、采集过程与实验设计的详细信息,源站未提供。

【适用场景】

根据侧写线索,该数据集可用于研究 HNF4a 对 IMA 生长、细胞身份维持及 KRAS 抑制应答的调控作用,支持表达谱层面的分类与机制探索。其主题标签表明数据属于高通量测序表达谱类型,因此适用于转录组层面的表达模式分析、样本分类探索以及围绕 HNF4a 与 KRAS 抑制应答关系的机制假设生成。由于本站分类为肿瘤 / 肺癌,该数据集也可能服务于肺癌相关研究背景下的表达谱比较与功能探索。但源站未提供具体的分析结果、验证实验或临床关联信息,因此其适用场景应限定在表达谱层面的探索性研究,不宜直接推断临床结论。

【使用方法】

侧写线索建议,下载数据文件 GSE294573_series_matrix.txt.gz,并按文件格式读取,即 GZIP 压缩包。使用时可先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入。由于该文件为系列矩阵文件,通常可用于获取样本层面的表达谱信息,但源站未提供具体的读取代码、字段说明或预处理步骤。因此,在实际使用中应依据文件实际内容进行字段核对与格式确认,避免直接假设数据结构。源站未提供关于标准化方法、批次校正或下游分析流程的具体指导。

【质量与限制】

该数据集的文件数量为 1,文件样例为 GSE294573_series_matrix.txt.gz,源站描述仅说明该 SuperSeries 由下列 SubSeries 组成。源站未提供样本量、重复数、测序深度、覆盖度、缺失值比例、批次信息或质控指标等质量相关细节。主题标签中的 GPL24247 与 9606 提供了平台与物种标识,但源站未提供平台性能验证或数据质量评估结果。因此,关于数据质量的系统评估信息,源站未提供。使用者在接入数据前应自行进行字段核对与质量检查,以确认数据是否满足具体分析需求。

【引用与许可】

该数据集的作者为 Headtlove 与 Essel Dadzie,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,发布时间为 Apr 14 202。源站未提供具体的引用格式、许可协议、使用限制或数据共享政策信息。因此,关于引用方式与许可条款的详细内容,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集时,应参考来源站 NCBI 的相关政策与数据集页面所附信息,但源站未提供具体许可说明。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE294573

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.

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