TAT-CRE吸入诱导肺癌小鼠模型与腺病毒Cre重组酶对比数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE294262

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Cre重组酶诱导型模型系统广泛应用于癌症研究，用于操控特定组织中的基因表达并诱导原位肿瘤生长。这些系统通常涉及将含有loxP侧翼等位基因的基因工程生物与表达Cre重组酶的生物进行杂交。该方法虽然有效，但面临因繁育需求而需要大量动物的挑战。癌症研究中其他常用的肿瘤诱导方法包括直接应用病毒Cre重组酶载体。该方法面临满足必要安全级别的设施可及性挑战。在此背景下，我们对TAT-CRE（生物安全级别S1）和腺病毒Cre重组酶诱导（生物安全级别S2）的由KrasG12D表达和Trp53缺失驱动的肺腺癌进行了全面比较。我们通过计算机断层扫描进行体内肺肿瘤监测、单细胞RNA测序、免疫组织化学和流式细胞术，以阐明TAT-CRE与腺病毒Cre重组酶诱导的肺腺癌之间的相似性和差异。

TAT-CRE诱导的肺肿瘤在微血管和巨噬细胞方面表现出差异，但与腺病毒-Cre重组酶诱导的肺肿瘤相比，具有相应的肿瘤发生和生长特征。综上所述，TAT-CRE是一种有价值的遗传工程安全级别S1替代方案，可用于癌症诱导，并可能应用于肺癌以外的其他癌症模型。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。