NCIH2170细胞系10X sc-multiome数据

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NCIH2170细胞系10X sc-multiome数据

GSE293273 数据集收录了 NCIH2170 肺癌细胞系的 10X sc-multiome 测序数据，共包含 1 个数据文件。NCIH2170 是一种携带大量染色体外 DNA（ecDNA）的肺癌细胞系，其 ecDNA 在细胞间存在较高的变异程度。该数据集通过单细胞多组学测序，同时覆盖基因表达与染色质可及性两个层面，可用于研究 ecDNA 存在条件下的基因表达模式和染色质可及性规律，支持单细胞多组学分析及 ecDNA 相关研究。数据集来源于 NCBI，作者为 Yue Wang，发布时间为 2024 年 3 月 28 日，在本站归类于肿瘤 / 肺癌方向。

【数据集背景】

NCIH2170 是一种肺癌细胞系，其显著特征是细胞内含有大量染色体外 DNA（ecDNA），并且这些 ecDNA 在不同细胞之间表现出较高的变异程度。染色体外 DNA 是独立于染色体基因组之外存在的 DNA 分子，在肿瘤细胞中较为常见，与肿瘤的异质性和基因表达调控密切相关。为研究 ecDNA 存在情况下细胞的基因表达模式与染色质可及性特征，研究者对该细胞系开展了 10X sc-multiome 测序，从而在单细胞分辨率上同时获取转录组和染色质开放状态的信息。该数据集正是这一研究工作的测序数据集合。

【数据内容】

该数据集包含 1 个数据文件，文件样例为 GSE293273_series_matrix.txt.gz，采用 GZIP 压缩格式。数据来自 10X sc-multiome 测序，覆盖基因表达与染色质可及性两个层面，可用于单细胞多组学分析。主题标签涉及高通量测序表达谱分析，并标注了平台 GPL24676 与物种编号 9606。数据集在本站归类为肿瘤 / 肺癌。

【采集与来源】

数据来源于 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov），源站标题为“10X sc-multiome data of NCIH2170 cell line”。作者为 Yue Wang，发布时间为 2024 年 3 月 28 日。源站描述说明，NCIH2170 细胞系携带大量细胞间变异较高的 ecDNA，研究者对其进行了 10X sc-multiome 测序，以研究 ecDNA 存在下的基因表达模式与染色质可及性规律。

【适用场景】

该数据集适用于单细胞多组学分析，尤其是同时考察基因表达与染色质可及性的研究场景；也适用于围绕 ecDNA 存在条件下的基因表达模式和染色质可及性规律开展的探索性分析。由于数据来自肺癌细胞系 NCIH2170，可用于肿瘤异质性相关的方法验证与预实验分析。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE293273_series_matrix.txt.gz，按 GZIP 压缩包格式进行读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入后续分析流程。

【质量与限制】

源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供。