BRCA1和BRCA2体细胞突变人肺腺癌肿瘤微环境的分子结构
LUAD 被认为是肺上皮中的异质性群体,同源重组修复(HRR)缺陷与非小细胞肺癌患者增强的免疫治疗反应相关,而 BRCA1 和 BRCA2 作为 DNA 修复的关键调控因子,其对 LUAD 中 TME 的影响尚不清楚

基本信息
资源简介
BRCA1和BRCA2体细胞突变人肺腺癌肿瘤微环境的分子结构
Molecular architecture of the tumor microenvironment caused by BRCA1 and BRCA2 somatic mutations in human lung adenocarcinoma
该数据集来自 NCBI GEO(GSE292700),采用 10x Genomics scRNA-seq 与 scTCR-seq 单细胞测序方法,研究 BRCA1 和 BRCA2 体细胞突变在人肺腺癌(LUAD)中引起的肿瘤微环境(TME)异质性与分子结构。LUAD 被认为是肺上皮中的异质性群体,同源重组修复(HRR)缺陷与非小细胞肺癌患者增强的免疫治疗反应相关,而 BRCA1 和 BRCA2 作为 DNA 修复的关键调控因子,其对 LUAD 中 TME 的影响尚不清楚。该研究全面刻画了 LUAD 患者中 BRCA 突变型 TME,揭示独特的免疫应答机制与潜在治疗策略,有助于理解 BRCA1/2 驱动的分子结构并改进治疗。数据含 1。
【数据集背景】
源站首次发布:Mar 24 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):我们采用 10x Genomics scRNAseq 和 scTCR-seq 的单细胞测序方法,研究由 BRCA1 和 BRCA2 体细胞突变在人肺腺癌(LUAD)中引起的肿瘤微环境(TME)的异质性和分子结构。LUAD 被认为是肺上皮中的异质性群体。同源重组修复(HRR)缺陷已被认为与非小细胞肺癌患者增强的免疫治疗反应相关。HRR 基因 BRCA1 和 BRCA2 是 DNA 修复的关键调控因子,但它们对 LUAD 中 TME 的影响仍不清楚。本研究全面刻画了 LUAD 患者中 BRCA 突变型 TME,揭示了独特的免疫应答机制和潜在治疗策略。这些发现增强了我们对 BRCA1/2 驱动的分子结构的理解,并为改善治疗效
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL34284、9606。本站分类:肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE292700
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· 源站最后修改于 Jul 30 202,引用时请注意版本时效。
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数据说明
我们采用10x Genomics单细胞RNA测序和单细胞TCR测序技术,研究了肺腺癌(LUAD)中BRCA1和BRCA2体细胞突变所导致的肿瘤微环境(TME)异质性及分子结构。肺腺癌被认为是肺上皮中的异质性群体。同源重组修复(HRR)缺陷与非小细胞肺癌患者免疫治疗反应增强有关。HRR基因BRCA1和BRCA2是DNA修复的关键调控因子,但它们对肺腺癌TME的影响仍不清楚。本研究全面刻画了肺腺癌患者中BRCA突变型TME的特征,揭示了不同的免疫应答机制和潜在治疗策略。这些发现增进了我们对BRCA1/2驱动的分子结构的理解,并为提高肺腺癌治疗效果提供了新见解。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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