巨噬细胞内在及IL-9依赖的精氨酸代谢促进肺肿瘤生长

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE292222

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数据说明

肿瘤相关巨噬细胞是一种丰富的肿瘤浸润细胞群体，通过产生免疫抑制性肿瘤免疫微环境（TIME），支持肿瘤细胞逃避免疫细胞的抗肿瘤检测。巨噬细胞的免疫抑制功能由细胞因子环境决定。IL-9是一种多效性细胞因子，可对肿瘤生长发挥正向或负向调控作用。我们实验室此前发现，IL-9通过扩增肺间质巨噬细胞群体并诱导精氨酸酶1（ARG1）表达来增强肿瘤生长，从而发挥促肿瘤作用。然而，IL-9R/ARG1+间质巨噬细胞促进肿瘤进展的潜在机制仍不完全清楚。在此，我们证明，含有Arg1 siRNA的巨噬细胞靶向纳米颗粒可在治疗上减轻肿瘤负荷，并减少促肿瘤精氨酸衍生代谢产物的生成。此外，通过对从Il9r-/-:WT混合骨髓嵌合小鼠中分离的肺巨噬细胞进行批量RNA测序，我们证明IL-9从内在层面改变了肺间质巨噬细胞的转录组格局。

在机制上，IL-9通过依赖IRF4的调控途径促进内在Arg1表达，并调节间质巨噬细胞和肺组织内精氨酸和多胺浓度，从而导致肺肿瘤生长增加和巨噬细胞表型改变。因此，我们的工作定义了IL-9反应性巨噬细胞的促肿瘤机制，该机制由肺间质巨噬细胞中内在精氨酸代谢改变所介导，从而促进肺肿瘤生长。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。