RIT1驱动肺致癌转化并是肺腺癌可操作靶点 [PDX]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE290503

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

RIT1是RAS家族的一种小型GTP酶，RIT1突变已在肺癌、白血病及发育障碍Noonan综合征中被发现。RIT1突变因蛋白水解受损而导致该癌蛋白水平升高，进而引起RAS/MAPK及其他通路的失调。本文记录了人肺癌中RIT1突变的多样性，并证明RIT1 M90I的生理性表达足以在小鼠模型中驱动体内原位肺肿瘤的发生。鉴于目前缺乏针对该癌蛋白的靶向治疗，我们采用了不同且互补的方法，以直接抑制RIT1或抑制下游RAS/MAPK通路。通过概念验证性的化学生物学方法，我们发现RAS三复合体抑制剂可直接结合GTP结合的RIT1并导致肿瘤缩小。这些分子为RIT1驱动的肺肿瘤提供了一种可行的治疗途径。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。