肿瘤中髓系祖细胞失调驱动免疫抑制性巨噬细胞 [数据集 3]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE289708

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

单核细胞来源的巨噬细胞（mo-macs）驱动肿瘤微环境（TME）中的免疫抑制，而肿瘤增强的骨髓（BM）髓系生成则为这些细胞群体提供来源。在此，我们对小鼠及肺癌患者的骨髓髓系祖细胞、单核细胞和肿瘤浸润性mo-macs进行了配对的转录组和染色质可及性分析，以鉴定驱动促肿瘤mo-macs的髓系祖细胞程序。我们发现，肿瘤在髓系祖细胞中为Nfe2l2（NRF2）启动可及性，作为对氧化应激的细胞保护反应。NRF2活性在TME中单核细胞分化过程中持续存在并增强，以调控mo-mac应激反应，进而促进mo-mac存活和抑制功能。NRF2基因缺失和药理学抑制显著降低了TME中mo-macs的存活和抑制程序，从而促成了NK和T细胞治疗性抗肿瘤免疫。总之，我们的研究鉴定了一个可成药的髓系祖细胞失调表观遗传节点，该节点维持TME中的免疫抑制性mo-macs。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。