ABL激酶失活促进转录-复制冲突并损害复制叉揭示转移性小细胞肺癌治疗脆弱性
研究聚焦转移性小细胞肺癌(SCLC),探讨ABL酪氨酸激酶失活如何促进转录-复制冲突、损害复制叉进程并增加DNA损伤,进而揭示治疗脆弱性

基本信息
资源简介
ABL激酶失活促进转录-复制冲突并损害复制叉揭示转移性小细胞肺癌治疗脆弱性
ABL Kinase Inactivation Promotes Transcription-Replication Conflicts and Compromises Replication Forks Revealing a Therapeutic Vulnerability in Metastatic Small Cell Lung Cancer
该数据集来自NCBI GEO,包含1个文件(GSE289452_series_matrix.txt.gz),主题为高通量测序表达谱分析,物种为人(9606),平台为GPL24676。研究聚焦转移性小细胞肺癌(SCLC),探讨ABL酪氨酸激酶失活如何促进转录-复制冲突、损害复制叉进程并增加DNA损伤,进而揭示治疗脆弱性。数据可用于分析ABL失活相关的基因表达变化,支持SCLC转移机制与DNA损伤修复通路的研究(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Feb 12 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):小细胞肺癌(SCLC)是一种高度侵袭性的神经内分泌癌症,通常在诊断时已发生转移,总生存率低。尽管对一线化疗或放疗高度敏感,但大多数SCLC患者仍会复发并死于全身性转移。我们在此报告,在小鼠模型中,ABL酪氨酸激酶的失活显著损害了转移性SCLC肿瘤的生长,从而延长了动物生存期。机制上,SCLC中ABL失活导致转录-复制冲突积累增加、复制叉进程受损、参与转录偶联同源重组的蛋白质表达和功能受损以及DNA损伤增加。由于ABL失活增加了DNA损伤,我们评估了在存在[描述截断]的情况下阻断DNA损伤修复通路活性是否[描述截断]。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24676、9606。本站分类:肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE289452
【使用注意】
· 源站最后修改于 Feb 13 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
小细胞肺癌(SCLC)是一种高度侵袭性的神经内分泌肿瘤,通常在诊断时已发生转移,且总体生存率较低。尽管SCLC对一线化疗或放疗高度敏感,但大多数患者仍会复发并死于全身性转移。在此,我们报告,在小鼠模型中,ABL酪氨酸激酶的失活显著抑制了转移性SCLC肿瘤的生长,从而延长了动物的生存期。机制上,SCLC中ABL的失活导致转录-复制冲突的积累增加、复制叉进程受损、参与转录偶联同源重组的蛋白质表达和功能受损,以及DNA损伤增加。由于ABL失活增加了DNA损伤,我们评估了在ABL抑制剂存在的情况下阻断DNA损伤修复通路的活性是否会协同促进SCLC细胞死亡。
我们发现,ABL激酶与共济失调毛细血管扩张症及Rad3相关蛋白(ATR)——复制应激的主要应答因子——的共同失活可在体外协同抑制SCLC细胞生长,并且与单药治疗小鼠相比,可损害转移播散和生长。因此,联合失活ABL激酶和DNA损伤修复通路或可用于阻断SCLC转移灶的播散和生长。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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