肺癌特异性BACH1转录特征数据集

该数据集来自NCBI,包含肺癌细胞中BACH1转录特征的高通量测序数据,文件为GSE288626_series_matrix.txt.gz

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基因组预测GPL185739606
GSE288626: A lung cancer specific BACH1 transcriptional signature for identifying novel BACH1 inhibitors

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-18

资源简介

肺癌特异性BACH1转录特征数据集

A lung cancer specific BACH1 transcriptional signature for identifying novel BACH1 inhibitors

该数据集来自NCBI,包含肺癌细胞中BACH1转录特征的高通量测序数据,文件为GSE288626_series_matrix.txt.gz。研究通过RNA-Seq与ChIP-Seq在BACH1功能正常和缺失的肺癌细胞中鉴定BACH1直接调控的基因集合,可用于探索BACH1在肺癌中的转录调控机制及筛选新型BACH1抑制剂(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Feb 03 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):转录因子BACH1是一种转录抑制因子,在调控氧化应激和抗炎通路中发挥核心作用,正成为包括神经退行性疾病、缺血再灌注损伤、镰状细胞病和癌症在内的多种疾病的有前景的治疗靶点。在癌症领域,BACH1已受到广泛关注,BACH1过表达与多种癌症类型的不良预后和转移相关;然而,尽管BACH1的相关性日益增加,尚未鉴定出BACH1的通用促转移机制或转录特征,这是该新兴领域的主要局限。为填补这一空白,本研究在BACH1功能正常和缺失的肺癌细胞中进行了RNA-Seq结合ChIP-Seq,鉴定出一组共同的BACH1直接调控基因,并对其进行了充分验证

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL18573、9606。本站分类:肿瘤/肺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE288626

【使用注意】

· 源站最后修改于 Aug 06 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

转录因子BACH1是一种转录抑制因子,在调控氧化应激和抗炎通路中发挥核心作用,正成为多种疾病颇具前景的治疗靶点,包括神经退行性疾病、缺血再灌注损伤、镰状细胞病和癌症。在癌症领域,BACH1已受到广泛关注,BACH1过表达与多种癌症类型的不良预后和转移相关;然而,尽管BACH1的相关性日益增加,尚未鉴定出BACH1通用的促转移机制或转录特征,这是该不断发展的领域的一大局限。为填补这一空白,本研究在BACH1功能正常和缺陷的肺癌细胞中进行了RNA-Seq联合ChIP-Seq,鉴定出一组BACH1直接调控的共同基因,并在大量癌细胞中进行了充分验证。这一新型肺癌BACH1转录特征对BACH1扰动(遗传学和药理学)具有高度敏感性和特异性,且不对NRF2调节产生响应,凸显了其特异性。

该特征不仅可作为BACH1活性的稳健替代指标,我们还提供了证据表明其潜在价值,可作为工具:i) 识别新型BACH1抑制剂;ii) 深入了解BACH1的促转移作用。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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