GSE286458：MAX失活解除MYC网络调控并在多组织诱导神经内分泌肿瘤 [ChIP-seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE286458

标准获取流程：

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2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

MYC转录因子需要MAX才能结合DNA并在正常细胞和肿瘤细胞中广泛激活基因表达。令人惊讶的是，MAX的失活突变与包括嗜铬细胞瘤、垂体腺瘤和小细胞肺癌在内的部分神经内分泌癌症相关。MAX的肿瘤抑制程度及其机制尚不清楚。我们在多种小鼠神经内分泌组织中敲除Max，发现单独失活Max即可产生垂体腺瘤，而Max失活缺失与Rb1/Trp53缺失协同作用，加速甲状腺髓样C细胞和垂体腺瘤的发展。在甲状腺肿瘤细胞系中，MAX缺失触发了MYC网络其他成员（MNT、MLX、MondoA）在基因组占据上的显著转变，从而支持肿瘤性神经内分泌细胞的代谢、存活和增殖。我们的工作揭示，MAX通过维持MYC网络中多种转录因子在基因组占据上的平衡，成为神经内分泌肿瘤发生的广泛抑制因子。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。