GSE285888:NSCLC患者基线PBMC单细胞RNA测序预测ICI疗效与irAE严重程度
该数据集来自NCBI GEO,包含NSCLC患者接受免疫检查点抑制剂治疗前的PBMC单细胞RNA测序数据,共1个文件。数据可用于探索免疫反应状态与预后、原发耐药与获得性耐药及缺氧环境的差异,并支持预测ICI疗效和irAE严重程度的生物标志物研究(来源 NCBI)

基本信息
资源简介
GSE285888:NSCLC患者基线PBMC单细胞RNA测序预测ICI疗效与irAE严重程度
Single-Cell RNA Sequencing of Baseline PBMCs Predicts ICI efficacy and irAE Severity in NSCLC Patients
该数据集来自NCBI GEO,包含NSCLC患者接受免疫检查点抑制剂治疗前的PBMC单细胞RNA测序数据,共1个文件。数据可用于探索免疫反应状态与预后、原发耐药与获得性耐药及缺氧环境的差异,并支持预测ICI疗效和irAE严重程度的生物标志物研究(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Jan 05 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):免疫检查点抑制剂(ICIs)为晚期非小细胞肺癌(NSCLC)患者带来了显著的临床获益和持久缓解,彻底改变了治疗格局。然而,仅极少数患者对ICI治疗有应答,且导致治疗中断的免疫相关不良事件(irAEs)仍是挑战。尽管已认识到需要能同时预测ICI疗效和irAE风险的生物标志物,但此类标志物尚未明确。在本研究中,我们对NSCLC患者接受ICI治疗前的外周血单个核细胞(PBMC)进行了单细胞RNA测序。我们发现,预后不良患者的免疫反应普遍降低。然而,与获得性耐药患者相比,原发耐药患者的缺氧环境尤为突出。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL16791、9606。本站分类:肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE285888
【使用注意】
· 源站最后修改于 May 28 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
免疫检查点抑制剂(ICIs)通过为晚期非小细胞肺癌(NSCLC)患者提供显著的临床获益和持久缓解,带来了革命性变化。然而,仅有极少数患者对ICI治疗产生应答,且导致治疗中断的免疫相关不良事件(irAEs)仍是挑战。尽管已认识到需要能够同时预测ICIs疗效和irAEs风险的生物标志物,但此类生物标志物尚未被明确识别。在本研究中,我们对NSCLC患者ICI治疗前的外周血单个核细胞(PBMC)进行了单细胞RNA测序。我们发现,预后不良患者的免疫应答普遍降低。然而,与获得性耐药患者相比,原发性耐药患者的缺氧环境尤为突出。同时,颗粒酶和穿孔素与良好预后密切相关。我们还确定IL1B和CXCL8是irAEs的关键预测因子,其激活与炎症相关。
此外,我们发现CD8+ T细胞和NK细胞中的PRF1在完全缓解和减少ICI治疗相关irAE中发挥关键介质作用。这些发现加深了我们对ICI疗效机制的理解,并为优化免疫治疗策略提供了宝贵信息。通过识别用于更好预后和irAE的生物标志物,本研究为个性化免疫治疗方法奠定了基础,旨在改善临床结局,同时最大限度降低与ICI治疗相关的风险。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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