非编码SNP rs17728461调控肺癌恶性进展 [4C-seq]
该数据集来自NCBI，标题为非编码SNP rs17728461调控肺癌恶性进展的4C-seq数据，用于检测H155（C/G）细胞中与rs17728461不同等位基因相互作用的靶基因
![GSE284335: Noncoding SNP rs17728461 regulates the malignant progression of lung cancer [4C-seq]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/75095.jpg)
基本信息
资源简介
非编码SNP rs17728461调控肺癌恶性进展 [4C-seq]
该数据集来自 NCBI，英文标题为“Noncoding SNP rs17728461 regulates the malignant progression of lung cancer [4C-seq]”，中文可理解为非编码 SNP rs17728461 调控肺癌恶性进展的 4C-seq 数据。其核心目的在于检测 H155（C/G）细胞中与 rs17728461 不同等位基因相互作用的靶基因，属于肿瘤/肺癌方向。数据集包含 1 个文件，样例文件名为 GSE284335_series_matrix.txt.gz，作者为 Xiaoling，Tian，发布时间为 Dec 15 202。整体来看，该数据集围绕非编码变异 rs17728461 在肺癌细胞中的染色质相互作用展开，适合关注肺癌分子机制、非编码 SNP 功能研究以及 4C-seq 技术应用的研究人员参考使用。
【数据集背景】
该数据集聚焦于非编码 SNP rs17728461 在肺癌恶性进展中的调控作用。非编码区域的单核苷酸多态性往往不直接改变蛋白编码序列，但可能通过影响染色质空间构象、调控元件活性或靶基因表达参与疾病过程。该数据集以 4C-seq 为技术手段，旨在检测 H155（C/G）细胞中与 rs17728461 不同等位基因相互作用的靶基因，从而为理解该非编码 SNP 如何影响肺癌恶性进展提供染色质相互作用层面的数据支持。源站标题同时点明“Noncoding SNP rs17728461 regulates the malignant progression of lung cancer”，说明该数据与肺癌进展调控研究直接相关。
【数据内容】
该数据集包含 1 个文件，文件样例为 GSE284335_series_matrix.txt.gz。从文件形式看，该文件为 GZIP 压缩包，通常用于存储系列矩阵信息。数据集主题标签包括 Other、GPL24676、9606，其中 9606 对应人类物种信息，GPL24676 为平台标识。数据集分类为肿瘤/肺癌，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。源站描述指出，该数据用于检测 H155（C/G）细胞中与 rs17728461 不同等位基因相互作用的靶基因。除上述信息外，源站未提供更详细的样本数量、重复数、测序深度、分析流程或结果文件说明。
【采集与来源】
该数据集来源于 NCBI，源站标题为“Noncoding SNP rs17728461 regulates the malignant progression of lung cancer [4C-seq]”。作者为 Xiaoling，Tian，发布时间为 Dec 15 202。数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，本站分类为肿瘤/肺癌。主题标签中的 9606 表明研究对象为人类，GPL24676 为相关平台标识。关于样本采集的具体组织来源、细胞培养条件、伦理审批信息、实验批次或测序平台详细参数，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于研究非编码 SNP rs17728461 在肺癌细胞中的调控机制，尤其是通过 4C-seq 检测染色质相互作用靶基因的场景。研究人员可将其用于探索 H155（C/G）细胞中不同等位基因对应的靶基因差异，进而分析该 SNP 与肺癌恶性进展之间的潜在联系。此外，该数据也可作为肺癌非编码变异功能研究、染色质构象研究或 4C-seq 方法学参考的辅助数据。对于关注肿瘤/肺癌分子机制、非编码 SNP 调控网络或人类基因组平台 GPL24676 相关数据的研究者，该数据集具有一定参考价值。具体适用性仍需结合源站提供的原始说明和实验设计判断。
【使用方法】
使用该数据集时，可先下载数据文件 GSE284335_series_matrix.txt.gz。该文件为 GZIP 压缩包，读取前需按相应格式进行解压或直接以支持 GZIP 的工具打开。建议先在小样本上核对字段与编码，确认数据格式、样本标识和矩阵内容无误后，再批量接入后续分析流程。由于该数据集仅包含 1 个文件，使用时应重点关注该文件中的矩阵信息是否满足分析需求。若需进行 4C-seq 相关分析，还需结合源站可能提供的其他配套信息。源站未提供具体分析步骤、软件参数或标准化流程，因此实际使用时需依据文件内容和研究目的自行设计分析方案。
【质量与限制】
该数据集的文件数量为 1，文件样例为 GSE284335_series_matrix.txt.gz，整体规模较小。其主题标签包括 Other、GPL24676、9606，分类为肿瘤/肺癌，来源为 NCBI。由于源站未提供样本数量、重复数、测序深度、数据完整性、质控指标或批次信息，无法对数据质量进行进一步评估。该数据集仅围绕 H155（C/G）细胞中 rs17728461 不同等位基因相互作用的靶基因进行检测，研究范围相对集中，结论外推需谨慎。此外，发布时间为 Dec 15 202，源站未提供更新记录或版本信息。使用者在分析前应自行核对数据完整性，并结合实验设计判断其适用性。
【引用与许可】
该数据集的作者为 Xiaoling，Tian，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，发布时间为 Dec 15 202。源站标题为“Noncoding SNP rs17728461 regulates the malignant progression of lung cancer [4C-seq]”。关于该数据集的引用方式、许可协议、使用限制或版权声明，源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集时，应直接访问 NCBI 源站页面，查看其最新的引用要求与许可条款。若源站未明确许可信息，建议遵循 NCBI 通用数据使用规范，并尊重作者署名与数据来源。
下载信息
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提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
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使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE284335
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
To examine target genes that interact with different alleles of rs17728461 in H155 (C/G) cells.
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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