临床小细胞肺癌样本单细胞RNA测序数据

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE281740

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

小细胞肺癌（SCLC）以其高度转移潜能而著称，大多数患者在诊断时已表现出多个器官的临床明显转移。导致这种异常转移能力的因素尚未明确。为填补这一空白，我们比较了在整个临床病程中从未发生转移或复发的SCLC患者样本与诊断时即存在转移性疾病的更典型患者的原发性SCLC样本中的基因表达。该分析鉴定出FOXA2是一种与SCLC转移密切相关的转录因子。随后在实验模型中的分析表明，FOXA2诱导胎儿神经内分泌基因表达程序并促进多部位转移。此外，我们发现ASCL1——一种已知在SCLC肿瘤发生中起起始作用的转录因子——是FOXA2启动子的直接结合因子及FOXA2表达的调控因子。综上所述，这些数据将ASCL1-FOXA2轴确定为多器官SCLC转移的关键驱动因素。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。