GSE280219:ONECUT2重编程神经内分泌命运并是小细胞肺癌的可操作治疗靶点

该数据集来自NCBI GEO,标题为ONECUT2重编程神经内分泌命运并是小细胞肺癌的可操作治疗靶点,属于肿瘤/肺癌分类

geo
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基因组分类GPL301739606
GSE280219: ONECUT2 reprograms neuroendocrine fate and is an actionable therapeutic target in small cell lung cancer.

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-18

资源简介

GSE280219:ONECUT2重编程神经内分泌命运并是小细胞肺癌的可操作治疗靶点

GSE280219 是 NCBI GEO 上的一个 SuperSeries 数据集,标题为“ONECUT2 reprograms neuroendocrine fate and is an actionable therapeutic target in small cell lung cancer”,即 ONECUT2 重编程神经内分泌命运并是小细胞肺癌的可操作治疗靶点。该数据集归入肿瘤 / 肺癌分类,由作者 Mirja、Rotinen 发布,发布时间为 Oct 24 202。数据集以高通量测序进行表达谱分析,主题标签涉及 GPL30173 平台与物种编号 9606,整体围绕小细胞肺癌中 ONECUT2 与神经内分泌命运的关系展开,为相关研究提供可下载的表达谱数据资源。

【数据集背景】

该数据集聚焦小细胞肺癌这一肿瘤类型,核心科学问题是 ONECUT2 对神经内分泌命运的重编程作用,以及其作为可操作治疗靶点的潜力。标题直接点明了研究的两层含义:一是 ONECUT2 参与神经内分泌命运的重编程,二是该分子在小细胞肺癌中具备治疗靶点的可操作性。数据集来自 NCBI GEO,属于肿瘤 / 肺癌分类,主题标签表明其采用高通量测序进行表达谱分析,并标注了 GPL30173 平台与物种编号 9606。源站描述说明该 SuperSeries 由下方列出的若干 SubSeries 组成,因此它本身是一个整合多个子系列的上层数据集条目。

【数据内容】

数据集的文件数量为 1,文件样例为 GSE280219_series_matrix.txt.gz,即一个 GZIP 压缩的系列矩阵文件。该文件通常承载系列层面的样本与表达信息,是接入该数据集的主要数据载体。主题标签中的“Expression profiling by high throughput sequencing”说明数据属于高通量测序表达谱类型;GPL30173 为平台标识,9606 为物种标识。除上述文件与标签信息外,源站未提供更细的样本数量、分组设计或具体基因层面的内容说明。

【采集与来源】

数据来源于 NCBI GEO(ncbi.nlm.nih.gov),以 SuperSeries 形式组织,源站描述明确其由所列 SubSeries 构成。作者为 Mirja、Rotinen,发布时间为 Oct 24 202。数据通过高通量测序方式产生表达谱信息,平台标识为 GPL30173,物种标识为 9606。关于样本采集的具体组织类型、处理条件、测序细节与实验流程,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于小细胞肺癌中 ONECUT2 相关表达谱分析,可用于考察 ONECUT2 与神经内分泌命运重编程之间的关系,也可作为探索该分子作为治疗靶点的数据基础。由于属于高通量测序表达谱类型,适合用于基因表达层面的比较与验证性分析。具体的研究设计匹配、对照设置与统计方案需结合源站 SubSeries 信息判断,源站未提供进一步说明。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE280219_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入,以避免因字段解析或编码问题导致后续分析偏差。由于该数据集为 SuperSeries,实际分析时应结合其下属 SubSeries 的说明理解数据结构。源站未提供更详细的分析流程或参数建议。

【质量与限制】

该数据集为 SuperSeries,源站描述仅说明其由若干 SubSeries 组成,未提供样本量、重复数、质控指标等信息,因此难以独立评估数据质量。文件数量为 1,主要数据载体为系列矩阵文件,若需原始测序数据或更细粒度信息,需参考 SubSeries。发布时间标注为 Oct 24 202,年份信息不完整。除此之外,源站未提供其他质量与限制说明。

【引用与许可】

该数据集的作者为 Mirja、Rotinen,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,引用时应注明数据集编号 GSE280219 及标题。关于许可条款与使用限制,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE280219

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.

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