GSE279930：STAU1在A549肺腺癌细胞中展现致癌特征并调控可变剪接与基因表达

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE279930

标准获取流程：

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   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Staufen双链RNA结合蛋白1（STAU1）在癌症发展中发挥重要作用，并与肺癌患者的生存结局相关。然而，其在肺腺癌（LUAD）中的具体功能和分子机制仍研究不足。在本研究中，我们在A549细胞系中建立了STAU1敲低表达模型。我们发现，STAU1敲低显著抑制了A549细胞的增殖、侵袭和迁移，并提高了细胞凋亡水平。通过RNA-seq分析，我们鉴定出197个差异表达基因（DEGs）和1,362个STAU1调控的可变剪接事件（ASEs）。DEGs特异性富集于细胞黏附通路，而ASE基因主要与细胞分裂和细胞周期相关。我们的研究表明，STAU1具有致癌特征，并可能通过调控DEGs和ASEs来影响A549细胞的增殖、侵袭和迁移。本研究提供了可能有助于LUAD诊断和治疗的新见解。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。