GSE278856：肺肿瘤微环境中肿瘤分期驱动的NK细胞成熟与细胞毒性功能破坏

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE278856

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

自然杀伤（NK）细胞在对抗癌症中发挥着关键作用，既可直接杀伤恶性细胞，也可通过分泌细胞因子和趋化因子促进适应性免疫应答。在肺部肿瘤微环境（TME）中，NK细胞数量稀少且功能失调，但其潜在机制仍不清楚。通过对肺部肿瘤进行单细胞转录组分析，并探索拟时序，我们发现TME以肿瘤分期依赖的方式破坏了NK细胞的成熟轨迹，最终导致细胞毒性亚群的选择性排除。利用功能实验，我们观察到肿瘤内NK细胞死亡以及细胞毒性能力的降低，且这一现象取决于肿瘤分期。最后，我们对人类肺癌公共数据集的分析证实了这些发现，揭示了肿瘤进展过程中NK细胞存在类似的成熟功能障碍过程。这些结果突出了肿瘤细胞逃避NK细胞细胞毒性的新机制，从而为定制化治疗策略铺平了道路。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。