RP小鼠SCLC原发肺肿瘤与转移肝肿瘤测序数据

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE278236

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在RP（Rb1fl/fl;Trp53fl/fl）小鼠中，经气管内注射由CMV启动子驱动的携带Cre重组酶的腺病毒八个月后，建立了SCLC表型肿瘤。从同一小鼠中收集原发肺肿瘤和转移性肝肿瘤进行测序，形成了一个数据集。将该数据集与我们RPΔG（Rb1fl/fl;Trp53fl/fl;GFP-LC3-RFP-LC3△G）小鼠中高自噬流和低自噬流亚群进行了相似性分析。分析显示，高自噬流亚群与转移数据表现出更大的相似性。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。