脂多糖诱导II型肺泡上皮细胞炎症表观遗传效应的多组学分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE275769

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

慢性炎症在多种肺部疾病的发病机制中发挥核心作用，包括哮喘、SARS-COVID19、阻塞性肺疾病（COPD）和肺癌。脂多糖（LPS）是大多数革兰氏阴性菌产生的炎症因子，也存在于香烟烟雾中。在小鼠炎症模型中，吸入暴露于LPS可诱导COPD，并增加烟草特异性亚硝胺诱导的肺肿瘤的大小和多发性。在本研究中，我们采用综合多组学方法，监测了A/J小鼠在亚慢性暴露于LPS后，其II型肺细胞中DNA甲基化/羟甲基化、基因表达和全局蛋白质丰度的变化。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。