非小细胞肺癌NK细胞来源细胞外囊泡作为新型过继细胞疗法的EV RNA数据集
该数据集来自NCBI GEO(GSE274584),聚焦非小细胞肺癌(NSCLC)中自然杀伤细胞来源细胞外囊泡(NKEV)作为过继细胞疗法的临床前研究
![GSE274584: Enhancing Non-Small Cell Lung Cancer Treatment Utilizing Natural Killer Cell-Derived Extracellular Vesicles (NKEVS) As A Novel Adoptive Cellular Therapeutic [EV RNA]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/141529.jpg)
基本信息
资源简介
非小细胞肺癌NK细胞来源细胞外囊泡作为新型过继细胞疗法的EV RNA数据集
Enhancing Non-Small Cell Lung Cancer Treatment Utilizing Natural Killer Cell-Derived Extracellular Vesicles (NKEVS) As A Novel Adoptive Cellular Therapeutic [EV RNA]
该数据集来自NCBI GEO(GSE274584),聚焦非小细胞肺癌(NSCLC)中自然杀伤细胞来源细胞外囊泡(NKEV)作为过继细胞疗法的临床前研究。数据包含EV RNA表达谱,基于高通量测序平台GPL24676(人9606),可用于探索NKEV的RNA货物特征及其在NSCLC治疗中的潜在功能,为免疫检查点抑制剂耐药肿瘤的细胞治疗研究提供转录组层面的参考(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Aug 12 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):导致免疫检查点抑制剂(ICI)治疗失败的一个已知机制是肿瘤通过下调人白细胞抗原(HLA)来逃逸T细胞应答。相反,在HLA表达缺失的情况下,自然杀伤(NK)细胞的效应功能会增强,这使得基于NK的细胞疗法成为对ICI耐药肿瘤有吸引力的选择。我们研究了在NSCLC中选择性分离NK细胞并采集NKEV的临床前疗效。单细胞RNA测序(scRNAseq)用于检查PBMC和肿瘤组织中的细胞景观。从PBMC中分离NK细胞,体外扩增,收集NK来源的EV(NKEV),并使用蛋白质组学和转录组学对EV的RNA和蛋白质货物进行表征。患者来源NKEV的功能能力通过3维类器官样结构衍生物进行了测定。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24676、9606。本站分类:肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE274584
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jul 28 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
导致免疫检查点抑制剂(ICI)治疗失败的已知机制之一是肿瘤通过下调人类白细胞抗原(HLA)来逃逸T细胞应答。相反,在HLA表达缺失的情况下,自然杀伤(NK)细胞的效应功能增强,这使得基于NK细胞的细胞疗法成为对ICI耐药肿瘤的一种有吸引力的选择。我们研究了在非小细胞肺癌(NSCLC)中利用选择性分离NK细胞并采集NKEV的临床前疗效。采用单细胞RNA测序(scRNAseq)检测PBMC和肿瘤组织中的细胞图谱。从PBMC中分离NK细胞,体外扩增,收集NK来源的EV(NKEV),并利用蛋白质组学和转录组学对EV的RNA和蛋白质货物进行表征。利用患者肿瘤细胞来源的三维类器官样结构检测患者来源NKEV的功能能力。本研究描述了NSCLC循环和肿瘤浸润免疫细胞的细胞图谱。
此外,研究还表明,可以从患者来源的扩增NK细胞中成功收获NKEVs,并强调了它们与标准治疗联合使用时的抗肿瘤特性。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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